RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 AMZ2Q86W34 360 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 GKN2Q86XP6 184 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 IFT81Q8WYA0 676 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TP53INP1Q96A56 240 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CFAP36Q96G28 342 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CRELD1Q96HD1 420 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 NRTNQ99748 197 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 GSDMCQ9BYG8 508 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 STRADBQ9C0K7 418 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 COG4Q9H9E3 785 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PADI4Q9UM07 663 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.26□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 A0A1W2PQM1 296 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 B8ZZF3 427 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 B4GAT1O43505 415 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 SLCO2B1O94956 709 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TNFSF15O95150 251 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TSPAN12O95859 305 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ESR1P03372 595 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ITGA2BP08514 1039 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 FURINP09958 794 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 F3P13726 295 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CTSEP14091 401 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PLA2G2AP14555 144 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PAMP19021 973 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 NME2P22392 152 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 FMO4P31512 558 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 AKT1P31749 480 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 FASLGP48023 281 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PREPP48147 710 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PDX1P52945 283 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CDKN2DP55273 166 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 RPE65Q16518 533 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TEX35Q5T0J7 233 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 WDR93Q6P2C0 686 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 LRRC6Q86X45 466 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 IFT20Q8IY31 132 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ARL10Q8N8L6 244 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 GDAP1Q8TB36 358 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 HM13Q8TCT9 377 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CD200R1Q8TD46 325 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 MED8Q96G25 268 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TMEM74Q96NL1 305 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 FMO2Q99518 471 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 OLFM1Q99784 485 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 MENTQ9BUN1 341 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 OGFRQ9NZT2 677 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.251e-323■□□□□ 11.3
NOP56-211ENST00000471023 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 RAB21Q9UL25 225 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 SATB2Q9UPW6 733 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 MAST4O15021 2626 aa7.25□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.24□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 KLHL33A6NCF5 533 aa7.24□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms