RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A ADI1Q03677 179 aa5.21□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A DED1P06634 604 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A LST4P34239 828 aa5.2□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A TMA10Q06177 86 aa5.2□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A GPB1Q08886 897 aa5.2□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A OXR1Q08952 273 aa5.2□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A PHO4P07270 312 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A SNF5P18480 905 aa5.19□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A ALG3P38179 458 aa5.19□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A PBP1P53297 722 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A YML122CQ03207 126 aa5.19□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A NTO1Q12311 748 aa5.19□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A SRM1P21827 482 aa5.18□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A STE11P23561 717 aa5.18□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A YHL050CP38721 697 aa5.18□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A YHR219WP38900 624 aa5.18□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A SEC23P15303 768 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A CTF4Q01454 927 aa5.17□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A YPL109CQ02981 657 aa5.17□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A TOS4Q06266 489 aa5.17□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A URN1Q06525 465 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A YPL260WQ08977 551 aa5.17□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A PMI40P29952 429 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A AIM21P40563 679 aa5.16□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A DAK2P43550 591 aa5.16□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A PHO23P50947 330 aa5.16□□□□□ -1.58
YHL009W-AYHL009W-A VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data5.16□□□□□ -1.58not detected
YHL009W-AYHL009W-A KIN2P13186 1147 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A GTF1P53260 183 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A CDC6P09119 513 aa5.13□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A APL1P27351 700 aa5.13□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A YFL054CP43549 646 aa5.13□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.13□□□□□ -1.59not detected
YHL009W-AYHL009W-A SVS1Q12254 260 aa5.13□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A YAP6Q03935 383 aa5.12□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A FAA3P39002 694 aa5.11□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A PIC2P40035 300 aa5.11□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A YLR224WQ05947 369 aa5.11□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A RIB2Q12362 591 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A RAD53P22216 821 aa5.1□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A EMC1P25574 760 aa5.1□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A MET4P32389 672 aa5.1□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A GCV2P49095 1034 aa5.1□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A VPS62P53285 467 aa5.1□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A TAF13P11747 167 aa5.09□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A GEF1P37020 779 aa5.09□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A ROD1Q02805 837 aa5.09□□□□□ -1.59
YHL009W-AYHL009W-A CHS7P38843 316 aa5.08□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A HXK1P04806 485 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A KIN4Q01919 800 aa5.07□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A HMI1Q12039 706 aa5.07□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A YER152CP10356 443 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A DCG1P32460 244 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A MKK2P32491 506 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A DEF1P35732 738 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A MSS4P38994 779 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A THI12P42883 340 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A THI5P43534 340 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A THI11P47183 340 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A SIZ1Q04195 904 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A THI13Q07748 340 aa5.06□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A RPT1P33299 467 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A RGD1P38339 666 aa5.05□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A PPX1P38698 397 aa5.05□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A PLB1P39105 664 aa5.05□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A NOP12Q08208 459 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A MLS1P30952 554 aa5.04□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A MSC2Q03455 724 aa5.04□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A PRE9P23638 258 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A SIP5P40210 489 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A MRPS18P42847 217 aa5.03□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A SIW14P53965 281 aa5.03□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A ATG13Q06628 738 aa5.03□□□□□ -1.6
YHL009W-AYHL009W-A PEP7P32609 515 aa5.02□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A MCD1Q12158 566 aa5.02□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A BAS1P22035 811 aa5.01□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A SYP1P25623 870 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A SEC8P32855 1065 aa5.01□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A PPM2Q08282 695 aa5.01□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A MSC6Q08818 692 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A WHI5Q12416 295 aa5.01□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A STM1P39015 273 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A IOC3P43596 787 aa5□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A CNN1P43618 361 aa5□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A ENT3P47160 408 aa5□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A ACE2P21192 770 aa4.99□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A TPO1Q07824 586 aa4.99□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A AIM39Q08223 395 aa4.99□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A OAR1P35731 278 aa4.98□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A UGA2P38067 497 aa4.98□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A POA1P38218 177 aa4.98□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A MXR1P40029 184 aa4.98□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A MND2P40577 368 aa4.98□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A MOH1P38191 138 aa4.97□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A HXT13P39924 564 aa4.97□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A MET12P46151 657 aa4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.6 ms