RNA–Protein interactions for RNA: YGL063W

PUS2, Transcript of Mitochondrial tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS2, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS2	YGL063W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PUS2	YGL063W	UBP11	P36026	717 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PUS2	YGL063W	YGL138C	P53122	345 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PUS2	YGL063W	GDE1	Q02979	1223 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PUS2	YGL063W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PUS2	YGL063W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	IRE1	P32361	1115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	POA1	P38218	177 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	EPL1	P43572	832 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	YNL115C	P53925	644 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	ISW1	P38144	1129 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	BRL1	P38770	471 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	TVP23	P38962	199 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	JHD1	P40034	492 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	YKE2	P52553	114 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	ARP5	P53946	755 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	GIS4	Q04233	774 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	PHM6	Q05637	104 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	ESS1	P22696	170 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	YEL025C	P39991	1188 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	YGR273C	P53329	174 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	SAS3	P34218	831 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	MDR1	P53258	950 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	GPI13	Q07830	1017 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	RET3	P53600	189 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	CRD1	Q07560	283 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PUS2	YGL063W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	AIM33	Q04516	312 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	CSM3	Q04659	317 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	YLR407W	Q06070	228 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	SWI6	P09959	803 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	CBP3	P21560	335 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	CIT3	P43635	486 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	SVF1	Q05515	481 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	CEX1	Q12453	761 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	YGR035C	P53222	116 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	DSE4	P53753	1117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	FUB1	P25659	250 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	ORC6	P38826	435 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	GAA1	P39012	614 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	SPO74	P45819	413 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	CDC6	P09119	513 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	MSS51	P32335	436 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	MFM1	Q02783	413 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	RIF1	P29539	1916 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	SUV3	P32580	737 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PUS2	YGL063W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	ASF1	P32447	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	YHL017W	P38745	532 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	CLN3	P13365	580 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	ATG32	P40458	529 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	SAD1	P43589	448 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	DIP5	P53388	608 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	BRE2	P43132	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	TRS120	Q04183	1289 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	PSK2	Q08217	1101 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	FIS1	P40515	155 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	BUD6	P41697	788 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	SKY1	Q03656	742 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	GSY1	P23337	708 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	YHR131C	P38835	850 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	DID4	P36108	232 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	CTF18	P49956	741 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	MUK1	Q02866	612 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUS2	YGL063W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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