RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627393.1

PCNP-208, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, human

TSL 2 BASIC

Gene PCNP, Length 136 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNP-208	ENST00000627393	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393		A0A0C4DFX4	3053 aa		5	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	CA12	O43570	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	ECE1	P42892	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	TMF1	P82094	1093 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	LTN1	O94822	1766 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	GNPAT	O15228	680 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCNP-208	ENST00000627393	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	CHRNA5	P30532	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	NFAT5	O94916	1531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	SCN4A	P35499	1836 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	AOC2	O75106	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	MAP2K2	P36507	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	COL6A3	P12111	3177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ITGB4	P16144	1822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	GYS1	P13807	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	RFC4	P35249	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	NFKBIE	O00221	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	SIK1	P57059	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ADRA2B	P18089	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ITPK1	Q13572	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	MPND	Q8N594	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PCNP-208	ENST00000627393	EPHX2	P34913	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	MEGF6	O75095	1541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393		H0YIN7	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	C21orf2	O43822	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	DDR1	Q08345	913 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	FKBP8	Q14318	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCNP-208	ENST00000627393	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63

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