RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 SLC15A2Q16348 729 aa28.09■■■□□ 2.09
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SGMS1-210ENST00000619438 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.08■■■□□ 2.09
SGMS1-210ENST00000619438 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.07■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 PAPPAQ13219 1627 aa28.06■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 NGEFQ8N5V2 710 aa28.05■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 PALLDQ8WX93 1383 aa28.05■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF521Q96K83 1311 aa28.05■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 CASZ1Q86V15 1759 aa28.04■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 PRKAR2BP31323 418 aa28.03■■■□□ 2.08
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SGMS1-210ENST00000619438 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.03■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.03■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SGMS1-210ENST00000619438 FCHSD2O94868 740 aa28.01■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.01■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.01■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 LGR6Q9HBX8 967 aa28■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28■■■□□ 2.07
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SGMS1-210ENST00000619438 ATG3Q9NT62 314 aa27.99■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.98■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 NEFMP07197 916 aa27.97■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.97■■■□□ 2.07
SGMS1-210ENST00000619438 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.97■■■□□ 2.07
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.94■■■□□ 2.06
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SGMS1-210ENST00000619438 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.92■■■□□ 2.06
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SGMS1-210ENST00000619438 MAP3K5Q99683 1374 aa27.9■■■□□ 2.06
SGMS1-210ENST00000619438 MSH5O43196 834 aa27.9■■■□□ 2.06
SGMS1-210ENST00000619438 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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SGMS1-210ENST00000619438 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SGMS1-210ENST00000619438 AK7Q96M32 723 aa27.89■■■□□ 2.06
SGMS1-210ENST00000619438 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
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SGMS1-210ENST00000619438 IL17REQ8NFR9 667 aa27.87■■■□□ 2.05
SGMS1-210ENST00000619438 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.87■■■□□ 2.05
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.87■■■□□ 2.05
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SGMS1-210ENST00000619438 ITPK1Q13572 414 aa27.85■■■□□ 2.05
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.83■■■□□ 2.05
SGMS1-210ENST00000619438 C4BP0C0L5 1744 aa27.82■■■□□ 2.04
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.82■■■□□ 2.04
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SGMS1-210ENST00000619438 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.81■■■□□ 2.04
SGMS1-210ENST00000619438 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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SGMS1-210ENST00000619438 PHF14O94880 888 aa27.8■■■□□ 2.04
SGMS1-210ENST00000619438 MCM10Q7L590 875 aa27.8■■■□□ 2.04
SGMS1-210ENST00000619438 E9PSI1 815 aa27.79■■■□□ 2.04
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SGMS1-210ENST00000619438 SMIM5Q71RC9 77 aa27.75■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.75■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.75■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 SSFA2P28290 1259 aa27.74■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF790Q6PG37 636 aa27.74■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 POLD1P28340 1107 aa27.73■■■□□ 2.03
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.73■■■□□ 2.03
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