RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 GCC1Q96CN9 775 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC96Q2M329 555 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 SEPT6Q14141 434 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 CLGNO14967 610 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 ABTB2Q8N961 1025 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 STRN4Q9NRL3 753 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP2C2O75185 946 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 AACSQ86V21 672 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 HSF2BPO75031 334 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP112Q8N8E3 955 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 HSPA4P34932 840 aa21.53■■□□□ 1.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 NOL3O60936 208 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.52■■□□□ 1.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 JADE2Q9NQC1 790 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ANO10Q9NW15 660 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CABP4P57796 275 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT32Q14532 448 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR78Q5VTH9 848 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 TTC36A6NLP5 189 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CETN1Q12798 172 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 RGS22Q8NE09 1264 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CA8P35219 290 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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PTPRJ-207ENST00000613246 POTEB2H3BUK9 544 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF4AO95239 1232 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB34Q9BZG1 259 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 YEATS4O95619 227 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTN2P35609 894 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRP6P59044 892 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 MSL1Q68DK7 614 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC45Q96CN5 670 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCF2Q9UG63 623 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3BP5O60239 455 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 AIDAQ96BJ3 306 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 CABP2Q9NPB3 220 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-207ENST00000613246 PRC1O43663 620 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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PTPRJ-207ENST00000613246 KIF3CO14782 793 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC63Q8NA47 563 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 BCAR3O75815 825 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB16Q05516 673 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 HYPKQ9NX55 129 aa21.44■■□□□ 1.02
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