RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598913.5

SAMD4B-208, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD4B, Length 2,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMD4B-208	ENST00000598913	SIRT1	Q96EB6	747 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	KIAA0232	Q92628	1395 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	KCNQ3	O43525	872 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	KCNA6	P17658	529 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	AKAP12	Q02952	1782 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	ERC2	O15083	957 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	CASC1	Q6TDU7	716 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	HMMR	O75330	724 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	LGR6	Q9HBX8	967 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	FLT4	P35916	1363 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	HOXC9	P31274	260 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SAMD4B-208	ENST00000598913	MX1	P20591	662 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	USP31	Q70CQ4	1352 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	ST18	O60284	1047 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	SBNO1	A3KN83	1393 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	REC8	O95072	547 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	TMX3	Q96JJ7	454 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	ARHGEF10	O15013	1369 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	GPT2	Q8TD30	523 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	SSH2	Q76I76	1423 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	ESPN	B1AK53	854 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SAMD4B-208	ENST00000598913	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	CHML	P26374	656 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	CPA1	P15085	419 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	NBPF4	Q96M43	638 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	RNF214	Q8ND24	703 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	RBSN	Q9H1K0	784 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	MPND	Q8N594	471 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	NUCB2	P80303	420 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	KDR	P35968	1356 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	GNAI3	P08754	354 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SAMD4B-208	ENST00000598913	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	SYCE3	A1L190	88 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	CLCN1	P35523	988 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	SPG7	Q9UQ90	795 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	MAP3K5	Q99683	1374 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	TBX22	Q9Y458	520 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	PROSER3	Q2NL68	480 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SAMD4B-208	ENST00000598913	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SAMD4B-208	ENST00000598913	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SAMD4B-208	ENST00000598913	DIP2A	Q14689	1571 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SAMD4B-208	ENST00000598913	PIK3C2A	O00443	1686 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SAMD4B-208	ENST00000598913	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SAMD4B-208	ENST00000598913	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SAMD4B-208	ENST00000598913	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		27.62	■■■□□ 2.01

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