RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 RBSNQ9H1K0 784 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 AFF2P51816 1311 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 GUCY2CP25092 1073 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 APAF1O14727 1248 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 TPM3P06753 285 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 GPATCH11Q8N954 259 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 SNX21Q969T3 373 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA2Q08379 1002 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 CASQ1P31415 396 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 RAI14Q9P0K7 980 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 ALKQ9UM73 1620 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-218ENST00000590367 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 DONSONQ9NYP3 566 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 REC8O95072 547 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 USP21Q9UK80 565 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 MST1RQ04912 1400 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 GPS2Q13227 327 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SIRT1Q96EB6 747 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 DIP2AQ14689 1571 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM177BA6PVY3 158 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 PRR29P0C7W0 189 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NUCB2P80303 420 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF1BO60333 1816 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF16BQ96L93 1317 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GUL7 405 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 DDIT3P35638 169 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP53Q96M91 514 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NWD1Q149M9 1564 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCC11Q96J66 1382 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF853P0CG23 659 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 UVSSAQ2YD98 709 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF18AQ8NI77 898 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF592Q92610 1267 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 DCCP43146 1447 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CYP2C19P33261 490 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 MBD3O95983 291 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 MCTP1Q6DN14 999 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 TSPY26PQ9H489 355 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms