RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 CHL1O00533 1208 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 ITGB4P16144 1822 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 TEFQ10587 303 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 BCL9O00512 1426 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 CABP4P57796 275 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 MBIPQ9NS73 344 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-210ENST00000568388 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.33■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 FAM182BQ5T319 152 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 SBF2Q86WG5 1849 aa24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 BTBD11A6QL63 1104 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 PAPPAQ13219 1627 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-210ENST00000568388 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 PIGBQ92521 554 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 NHSQ6T4R5 1651 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF790Q6PG37 636 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 BAG6P46379 1132 aa24.23■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 KCNQ3O43525 872 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-210ENST00000568388 SLC39A6Q13433 755 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 ATG3Q9NT62 314 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 KCNQ2O43526 872 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 VAMP4O75379 141 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF428Q96B54 188 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 BTAF1O14981 1849 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM37O94972 964 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 HOXB7P09629 217 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 TSPYL6Q8N831 410 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 CACNA1FO60840 1977 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 KRT24Q2M2I5 525 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-210ENST00000568388 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 RREB1Q92766 1687 aa24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 C5P01031 1676 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 LY75O60449 1722 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 APBA3O96018 575 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-210ENST00000568388 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.08■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 PALLDQ8WX93 1383 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 LRP5O75197 1615 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 TJP1Q07157 1748 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 281.1 ms