RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 KCNQ3O43525 872 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 PANK1Q8TE04 598 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 DCAF5Q96JK2 942 aa22.7■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
HERC2-208ENST00000566635 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.7■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 PDE3AQ14432 1141 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 KIF16BQ96L93 1317 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 RLBP1P12271 317 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 NGLY1Q96IV0 654 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 TRIM27P14373 513 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 COG6Q9Y2V7 657 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 TNS2Q63HR2 1409 aa22.64■■□□□ 1.22
HERC2-208ENST00000566635 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 SLC39A6Q13433 755 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 CABP4P57796 275 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 NECTIN2Q92692 538 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 C5P01031 1676 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 PAPPAQ13219 1627 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 ZNF790Q6PG37 636 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.59■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 EXOC5O00471 708 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 VPS72Q15906 364 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 USP21Q9UK80 565 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 GLI3P10071 1580 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC2-208ENST00000566635 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.58■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 SLC4A2P04920 1241 aa22.58■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 MS4A1P11836 297 aa22.58■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.58■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 RGS12O14924 1447 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.57■■□□□ 1.2
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HERC2-208ENST00000566635 BARGINQ6ZT62 677 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 ITGB4P16144 1822 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 HOXB7P09629 217 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 G2E3Q7L622 706 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 STK31Q9BXU1 1019 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 DDB1Q16531 1140 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 ABCC4O15439 1325 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 CACNA1FO60840 1977 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 AFF2P51816 1311 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 PTPRCP08575 1304 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC2-208ENST00000566635 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 FLIIQ13045 1269 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 ANXA1P04083 346 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 PIGBQ92521 554 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 ATRNO75882 1429 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 F6X3S4 739 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 BCL9O00512 1426 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 PROSER3Q2NL68 480 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC2-208ENST00000566635 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 A0A0G2JS52 829 aa22.45■■□□□ 1.18
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