RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 TJP1Q07157 1748 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 CABP4P57796 275 aa23.83■■□□□ 1.41
CS-219ENST00000550655 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 ITPK1Q13572 414 aa23.81■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.81■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.81■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 LGR6Q9HBX8 967 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.79■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.79■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 NUDCQ9Y266 331 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 MAP3K5Q99683 1374 aa23.78■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 PRKAR2BP31323 418 aa23.77■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 ATP6V1AP38606 617 aa23.77■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.77■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CS-219ENST00000550655 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.76■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.76■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 AK7Q96M32 723 aa23.76■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.75■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 C4AP0C0L4 1744 aa23.74■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 RALBP1Q15311 655 aa23.73■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.72■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 FCHSD2O94868 740 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 SMIM5Q71RC9 77 aa23.71■■□□□ 1.39
CS-219ENST00000550655 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 MSH5O43196 834 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 SSFA2P28290 1259 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 ARXQ96QS3 562 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 GNPATO15228 680 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 IL17REQ8NFR9 667 aa23.69■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 PHF14O94880 888 aa23.68■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 SLC39A6Q13433 755 aa23.67■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 POLD1P28340 1107 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 MSL1Q68DK7 614 aa23.66■■□□□ 1.38
CS-219ENST00000550655 SYT17Q9BSW7 474 aa23.64■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.63■■□□□ 1.37
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CS-219ENST00000550655 TEFQ10587 303 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 RPS6KA4O75676 772 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 ADRA2BP18089 450 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 ZNF790Q6PG37 636 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 MCM10Q7L590 875 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-219ENST00000550655 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 DCTN1Q14203 1278 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 KLHL34Q8N239 644 aa23.54■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 BTBD11A6QL63 1104 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 NEFMP07197 916 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 NFE2L2Q16236 605 aa23.53■■□□□ 1.36
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CS-219ENST00000550655 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 KCNQ3O43525 872 aa23.52■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.52■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.52■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.52■■□□□ 1.36
CS-219ENST00000550655 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 GYS1P13807 737 aa23.51■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 RFC4P35249 363 aa23.51■■□□□ 1.35
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CS-219ENST00000550655 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.5■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 COL15A1P39059 1388 aa23.5■■□□□ 1.35
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