RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540082.1

TOMM20P2-201, Transcript of TOMM20 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene TOMM20P2, Length 421 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20P2-201ENST00000540082 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 KCNA4P22459 653 aa6.56□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 GRM1Q13255 1194 aa6.56□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 SBF1O95248 1867 aa6.56□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 TMF1P82094 1093 aa6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 USP54Q70EL1 1684 aa6.55□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 KCNA3P22001 575 aa6.54□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 RGL3Q3MIN7 710 aa6.54□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 HOMEZQ8IX15 550 aa6.54□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.54□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 ERBB3P21860 1342 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 C5P01031 1676 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 POTEIP0CG38 1075 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 POTEJP0CG39 1038 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 RASSF7Q02833 373 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 ERFEQ4G0M1 354 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 CNTROBQ8N137 903 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 CABP2Q9NPB3 220 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 SLIT3O75094 1523 aa6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TOMM20P2-201ENST00000540082 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.52□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.52□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 NSD2O96028 1365 aa6.52□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 PALLDQ8WX93 1383 aa6.52□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CACNA1AO00555 2505 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 LTBP1Q14766 1721 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 GNPATO15228 680 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 SMIM5Q71RC9 77 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 BCL11AQ9H165 835 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.51□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 C4BP0C0L5 1744 aa6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CEP290O15078 2479 aa6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 NOGQ13253 232 aa6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CDK19Q9BWU1 502 aa6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 HACL1Q9UJ83 578 aa6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.5□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TTLL6Q8N841 843 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 FAM122AQ96E09 287 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 MEGF6O75095 1541 aa6.49□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 SCN4AP35499 1836 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 AOC2O75106 756 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 EPHX2P34913 555 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 RFC4P35249 363 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 PLA2G5P39877 138 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.48□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 C4AP0C0L4 1744 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 SOX12O15370 315 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 COL9A1P20849 921 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 CHRNA5P30532 468 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.47□□□□□ -1.37
TOMM20P2-201ENST00000540082 NFKBIEO00221 500 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.46□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 RGPD5Q99666 1765 aa6.45□□□□□ -1.38
TOMM20P2-201ENST00000540082 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.45□□□□□ -1.38
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