RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513053.5

FAM200B-219, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 748 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-219	ENST00000513053	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		29.11	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	LGR6	Q9HBX8	967 aa		29.11	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	C4B	P0C0L5	1744 aa		29.1	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	ATP6V1A	P38606	617 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	29.09	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	RALBP1	Q15311	655 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	PRKAR2B	P31323	418 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	ITPK1	Q13572	414 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM200B-219	ENST00000513053	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	FCHSD2	O94868	740 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	AK7	Q96M32	723 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	MRC1	P22897	1456 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAM200B-219	ENST00000513053	MSH5	O43196	834 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	SSFA2	P28290	1259 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	ARX	Q96QS3	562 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
FAM200B-219	ENST00000513053	GNPAT	O15228	680 aa		28.95	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	SLC39A6	Q13433	755 aa		28.95	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	SMIM5	Q71RC9	77 aa		28.95	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	PHF14	O94880	888 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	POLD1	P28340	1107 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	TEF	Q10587	303 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	TJP1	Q07157	1748 aa		28.91	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		28.89	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.89	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.89	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
FAM200B-219	ENST00000513053	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	RPS6KA4	O75676	772 aa		28.88	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	NEFM	P07197	916 aa		28.88	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		28.88	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		28.87	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	ADRA2B	P18089	450 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	MCM10	Q7L590	875 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
FAM200B-219	ENST00000513053	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	RFC4	P35249	363 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAM200B-219	ENST00000513053	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	KCNQ3	O43525	872 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	STARD3NL	O95772	234 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	GYS1	P13807	737 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.72	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.72	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.71	■■■□□ 2.19
FAM200B-219	ENST00000513053	MMP10	P09238	476 aa		28.7	■■■□□ 2.18

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