RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472045.1

IRF1-208, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene IRF1, Length 5,153 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-208ENST00000472045 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 CCDC69A6NI79 296 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 ORAI2Q96SN7 254 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 POLD1P28340 1107 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 USP5P45974 858 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 SETDB2Q96T68 719 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF1-208ENST00000472045 ATP2B1P20020 1258 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 RAB11FIP3O75154 756 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 NEK4P51957 841 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 NUCB2P80303 420 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 SLC39A6Q13433 755 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 SLF2Q8IX21 1173 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 SOGA3Q5TF21 947 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PTPRCP08575 1304 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PIK3R4Q99570 1358 aa14.63□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 MBIPQ9NS73 344 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 MAP3K12Q12852 859 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 IP6K1Q92551 441 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 POLKQ9UBT6 870 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 MCM2P49736 904 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.61□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 ANKRD1Q15327 319 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 MAPKBP1O60336 1514 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 SIRT1Q96EB6 747 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 ARHGEF10O15013 1369 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 ANXA1P04083 346 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PDCP20941 246 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 HOXC9P31274 260 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 DCAF5Q96JK2 942 aa14.6□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 SAMD9Q5K651 1589 aa14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 RABEP1Q15276 862 aa14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 USP21Q9UK80 565 aa14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 TXLNAP40222 546 aa14.58□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.58□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.58□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 NLRP3Q96P20 1036 aa14.58□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.58□□□□□ -0.07
IRF1-208ENST00000472045 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.58□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 STK32BQ9NY57 414 aa14.58□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 IL16Q14005 1332 aa14.58□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 MX1P20591 662 aa14.58□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.58□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 A0A1W2PP64 1363 aa14.57□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.57□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 LTKP29376 864 aa14.57□□□□□ -0.08
IRF1-208ENST00000472045 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms