RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 RSPH6AQ9H0K4 717 aa39.22■■■■□ 3.87
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FBXO18-208ENST00000470089 MTFR1LQ9H019 292 aa39.21■■■■□ 3.87
FBXO18-208ENST00000470089 RNMTO43148 476 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
FBXO18-208ENST00000470089 ATP6V1AP38606 617 aa39.19■■■■□ 3.86
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FBXO18-208ENST00000470089 LINC00116Q8NCU8 138 aa39.18■■■■□ 3.86
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FBXO18-208ENST00000470089 PHACTR3Q96KR7 559 aa39.17■■■■□ 3.86
FBXO18-208ENST00000470089 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa39.16■■■■□ 3.86
FBXO18-208ENST00000470089 RALBP1Q15311 655 aa39.16■■■■□ 3.86
FBXO18-208ENST00000470089 GAS2L2Q8NHY3 880 aa39.16■■■■□ 3.86
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FBXO18-208ENST00000470089 SLC52A2Q9HAB3 445 aa39.15■■■■□ 3.86
FBXO18-208ENST00000470089 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
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FBXO18-208ENST00000470089 ZNF831Q5JPB2 1677 aa39.1■■■■□ 3.85
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FBXO18-208ENST00000470089 SMIM5Q71RC9 77 aa39.1■■■■□ 3.85
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FBXO18-208ENST00000470089 GNAT3A8MTJ3 354 aa39.09■■■■□ 3.85
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FBXO18-208ENST00000470089 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
FBXO18-208ENST00000470089 PHF14O94880 888 aa39.06■■■■□ 3.84
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FBXO18-208ENST00000470089 COL24A1Q17RW2 1714 aa39.03■■■■□ 3.84
FBXO18-208ENST00000470089 GNPATO15228 680 aa39.03■■■■□ 3.84
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FBXO18-208ENST00000470089 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
FBXO18-208ENST00000470089 DCAF8L1A6NGE4 600 aa38.69■■■■□ 3.78
FBXO18-208ENST00000470089 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
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FBXO18-208ENST00000470089 STARD3NLO95772 234 aa38.68■■■■□ 3.78
FBXO18-208ENST00000470089 GYS1P13807 737 aa38.68■■■■□ 3.78
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