RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 FCHSD2O94868 740 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEFMP07197 916 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C5P01031 1676 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LGR6Q9HBX8 967 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP3K5Q99683 1374 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TEFQ10587 303 aa26.3■■□□□ 1.8
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.3■■□□□ 1.8
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 POLD1P28340 1107 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTGER2P43116 358 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNPATO15228 680 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRC1P22897 1456 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SSFA2P28290 1259 aa26.25■■□□□ 1.79
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC39A6Q13433 755 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARXQ96QS3 562 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.19■■□□□ 1.78
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLHL34Q8N239 644 aa26.16■■□□□ 1.78
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF790Q6PG37 636 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NFE2L2Q16236 605 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RFC4P35249 363 aa26.13■■□□□ 1.77
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCTN1Q14203 1278 aa26.12■■□□□ 1.77
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYT17Q9BSW7 474 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STARD3NLO95772 234 aa26.11■■□□□ 1.77
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANP32CO43423 234 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIPK4P57078 832 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.05■■□□□ 1.76
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 RUNDC1Q96C34 613 aa26.03■■□□□ 1.76
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