RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 RTL1A6NKG5 1358 aa22.45■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.45■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SOX12O15370 315 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 GPT2Q8TD30 523 aa22.44■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CASC1Q6TDU7 716 aa22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ST18O60284 1047 aa22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CHL1O00533 1208 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SSH2Q76I76 1423 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.41■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP7D2Q96T17 732 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.39■■□□□ 1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 REC8O95072 547 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.39■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A2P04920 1241 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRCP08575 1304 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 UQCRHP07919 91 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM5P33992 734 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.38■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0232Q92628 1395 aa22.37■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 ERC2O15083 957 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 F6X3S4 739 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.35■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 SYCE3A1L190 88 aa22.34■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE1AP54750 535 aa22.34■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 G2E3Q7L622 706 aa22.34■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.33■■□□□ 1.17
RALGPS1-208ENST00000424082 PEAK1Q9H792 1746 aa22.33■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 USP31Q70CQ4 1352 aa22.33■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 HMMRO75330 724 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 NEK4P51957 841 aa22.32■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 DYNC1I1O14576 645 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.31■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CRB1P82279 1406 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXO3O43524 673 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 TMX3Q96JJ7 454 aa22.3■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3C2AO00443 1686 aa22.29■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 MBD3O95983 291 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP6P59044 892 aa22.28■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.27■■□□□ 1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF214Q8ND24 703 aa22.26■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.26■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PALD1Q9ULE6 856 aa22.26■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.25■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.25■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 GNAI2P04899 355 aa22.24■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.24■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 BRD1O95696 1058 aa22.24■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 C14orf37Q86TY3 774 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ABTB2Q8N961 1025 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPY26PQ9H489 355 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 MX1P20591 662 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.23■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 RILPL2Q969X0 211 aa22.22■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.21■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.21■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 AMPHP49418 695 aa22.2■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.2■■□□□ 1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM2P49736 904 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.4 ms