RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NEDD4P46934 1319 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MST1RQ04912 1400 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CHGAP10645 457 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SBNO1A3KN83 1393 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MCM10Q7L590 875 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRCP08575 1304 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 FLT4P35916 1363 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 EYA1Q99502 592 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM3BQ7LBC6 1761 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMLP26374 656 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ACEP12821 1306 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CANXP27824 592 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1FO60840 1977 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA4P34932 840 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ITSN1Q15811 1721 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC2Q86VQ3 553 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL34Q8N239 644 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 FMN2Q9NZ56 1722 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TMX3Q96JJ7 454 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PXDNQ92626 1479 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 AOX1Q06278 1338 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ANAPC15P60006 121 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 COL15A1P39059 1388 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD50Q92878 1312 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HSCBQ8IWL3 235 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 F6X3S4 739 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TCHHQ07283 1943 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKARQ7Z5J8 1434 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K5Q99683 1374 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP8B2P98198 1209 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ERBB3P21860 1342 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SGSM2O43147 1006 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX22Q9Y458 520 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LARGE1O95461 756 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 FLIIQ13045 1269 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 BEND3Q5T5X7 828 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TNRQ92752 1358 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LMOD3Q0VAK6 560 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC173Q0VFZ6 552 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MED23Q9ULK4 1368 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 UTYO14607 1347 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC21AQ8NDW8 1320 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RUFY3Q7L099 469 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A2P04920 1241 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa4.46□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NUCB2P80303 420 aa4.46□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MX1P20591 662 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 PDIA6Q15084 440 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 GBP4Q96PP9 640 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 SLIT3O75094 1523 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPOAP1O95153 1857 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 COG3Q96JB2 828 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 ERC2O15083 957 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXB7P09629 217 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 NECTIN1Q15223 517 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 MCM5P33992 734 aa4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms