RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390868.1

RNU1-77P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 77, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-77P, Length 162 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-77P-201ENST00000390868 ARXQ96QS3 562 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 POLD1P28340 1107 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 PPP2R1AP30153 589 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 DCAF5Q96JK2 942 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 SYT17Q9BSW7 474 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU1-77P-201ENST00000390868 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 PRKAR2BP31323 418 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 KDRP35968 1356 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 CFAP53Q96M91 514 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 YY1P25490 414 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 DCTN1Q14203 1278 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 GPR162Q16538 588 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 TJP1Q07157 1748 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 MCM10Q7L590 875 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 KCNQ3O43525 872 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 IL17REQ8NFR9 667 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 NUDCQ9Y266 331 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 MAP3K5Q99683 1374 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 C4AP0C0L4 1744 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 MMP10P09238 476 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 SSFA2P28290 1259 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 RFC4P35249 363 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 TEFQ10587 303 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU1-77P-201ENST00000390868 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 RPS6KA4O75676 772 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 MRC1P22897 1456 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 BTBD11A6QL63 1104 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 GYS1P13807 737 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 FKBP8Q14318 412 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 A0A0G2JLW4 131 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 NEUROD2Q15784 382 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 COL15A1P39059 1388 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZPR1O75312 459 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 A1BGP04217 495 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 NEFMP07197 916 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU1-77P-201ENST00000390868 DDR1Q08345 913 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms