RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328379.5

PTRHD1-201, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRHD1, Length 1,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1-201ENST00000328379 KLHL34Q8N239 644 aa23.71■■□□□ 1.39
PTRHD1-201ENST00000328379 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.71■■□□□ 1.39
PTRHD1-201ENST00000328379 CFAP53Q96M91 514 aa23.71■■□□□ 1.39
PTRHD1-201ENST00000328379 MAP3K5Q99683 1374 aa23.7■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.7■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.69■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 SSFA2P28290 1259 aa23.69■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 PHF14O94880 888 aa23.68■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 ITPK1Q13572 414 aa23.68■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 C4BP0C0L5 1744 aa23.67■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 GNPATO15228 680 aa23.66■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 YY1P25490 414 aa23.66■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 NUDCQ9Y266 331 aa23.66■■□□□ 1.38
PTRHD1-201ENST00000328379 MSL1Q68DK7 614 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTRHD1-201ENST00000328379 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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PTRHD1-201ENST00000328379 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTRHD1-201ENST00000328379 GPR162Q16538 588 aa23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 LGR6Q9HBX8 967 aa23.63■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.62■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 PPP2R1AP30153 589 aa23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.6■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 RPS6KA4O75676 772 aa23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 ADRA2BP18089 450 aa23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 SMIM5Q71RC9 77 aa23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.59■■□□□ 1.37
PTRHD1-201ENST00000328379 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.58■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 RFC4P35249 363 aa23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTRHD1-201ENST00000328379 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.54■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 FCHSD2O94868 740 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTRHD1-201ENST00000328379 TEFQ10587 303 aa23.53■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 GRIN3BO60391 1043 aa23.52■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 PRKAR2BP31323 418 aa23.52■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 SLC39A6Q13433 755 aa23.52■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.52■■□□□ 1.36
PTRHD1-201ENST00000328379 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.5■■□□□ 1.35
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PTRHD1-201ENST00000328379 MMP10P09238 476 aa23.49■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 IL17REQ8NFR9 667 aa23.49■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.49■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 NEFMP07197 916 aa23.48■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.48■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.48■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 GYS1P13807 737 aa23.46■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 MRC1P22897 1456 aa23.46■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.46■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 CHD4Q14839 1912 aa23.45■■□□□ 1.35
PTRHD1-201ENST00000328379 STARD3NLO95772 234 aa23.45■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 ZPR1O75312 459 aa23.44■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF790Q6PG37 636 aa23.44■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.43■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 RALBP1Q15311 655 aa23.42■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 BTBD11A6QL63 1104 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTRHD1-201ENST00000328379 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.4■■□□□ 1.34
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 TJP1Q07157 1748 aa23.39■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.39■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 A0A087WZG4 1122 aa23.37■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 FKBP8Q14318 412 aa23.37■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 NARFQ9UHQ1 456 aa23.37■■□□□ 1.33
PTRHD1-201ENST00000328379 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.37■■□□□ 1.33
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