RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.63■■□□□ 1.85
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PARL-201ENST00000311101 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.62■■□□□ 1.85
PARL-201ENST00000311101 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PARL-201ENST00000311101 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.62■■□□□ 1.85
PARL-201ENST00000311101 ITPK1Q13572 414 aa26.6■■□□□ 1.85
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PARL-201ENST00000311101 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.59■■□□□ 1.85
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PARL-201ENST00000311101 FCHSD2O94868 740 aa26.58■■□□□ 1.85
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PARL-201ENST00000311101 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.58■■□□□ 1.85
PARL-201ENST00000311101 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.58■■□□□ 1.85
PARL-201ENST00000311101 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.58■■□□□ 1.85
PARL-201ENST00000311101 C4BP0C0L5 1744 aa26.58■■□□□ 1.85
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PARL-201ENST00000311101 AK7Q96M32 723 aa26.53■■□□□ 1.84
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PARL-201ENST00000311101 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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PARL-201ENST00000311101 ARXQ96QS3 562 aa26.5■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 SYT17Q9BSW7 474 aa26.5■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.49■■□□□ 1.83
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PARL-201ENST00000311101 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.47■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 PHF14O94880 888 aa26.47■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 YY1P25490 414 aa26.47■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.46■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 GNPATO15228 680 aa26.46■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
PARL-201ENST00000311101 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
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PARL-201ENST00000311101 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.45■■□□□ 1.82
PARL-201ENST00000311101 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.44■■□□□ 1.82
PARL-201ENST00000311101 TJP1Q07157 1748 aa26.44■■□□□ 1.82
PARL-201ENST00000311101 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.43■■□□□ 1.82
PARL-201ENST00000311101 SSFA2P28290 1259 aa26.43■■□□□ 1.82
PARL-201ENST00000311101 MCM10Q7L590 875 aa26.43■■□□□ 1.82
PARL-201ENST00000311101 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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PARL-201ENST00000311101 NEFMP07197 916 aa26.39■■□□□ 1.82
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PARL-201ENST00000311101 ZNF790Q6PG37 636 aa26.38■■□□□ 1.81
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PARL-201ENST00000311101 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.36■■□□□ 1.81
PARL-201ENST00000311101 BTBD11A6QL63 1104 aa26.35■■□□□ 1.81
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PARL-201ENST00000311101 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
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PARL-201ENST00000311101 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
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PARL-201ENST00000311101 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
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PARL-201ENST00000311101 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.31■■□□□ 1.8
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PARL-201ENST00000311101 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PARL-201ENST00000311101 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.29■■□□□ 1.8
PARL-201ENST00000311101 RFC4P35249 363 aa26.28■■□□□ 1.8
PARL-201ENST00000311101 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.28■■□□□ 1.8
PARL-201ENST00000311101 C4AP0C0L4 1744 aa26.28■■□□□ 1.8
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