RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 USP6P35125 1406 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
PDE4A-201ENST00000293683 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 RILPL2Q969X0 211 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 SIRT1Q96EB6 747 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 MX1P20591 662 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 IL25Q9H293 177 aa21.12■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.12■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 FLIIQ13045 1269 aa21.11■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 CHMLP26374 656 aa21.11■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGEF10O15013 1369 aa21.11■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 USP31Q70CQ4 1352 aa21.11■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 RNF214Q8ND24 703 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 STK31Q9BXU1 1019 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 EYA1Q99502 592 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 OFD1O75665 1012 aa21.09■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 BRD1O95696 1058 aa21.09■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.09■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.08■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.08■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.08■□□□□ 0.97
PDE4A-201ENST00000293683 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.08■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 TPM2P07951 284 aa21.07■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 CUL4AQ13619 759 aa21.07■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.07■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 ATP8B2P98198 1209 aa21.06■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.06■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 KDRP35968 1356 aa21.06■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 AMPHP49418 695 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 SSH2Q76I76 1423 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 FLT4P35916 1363 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 GNAI3P08754 354 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 MCCP23508 829 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 LTKP29376 864 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.04■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.04■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 TNRQ92752 1358 aa21.04■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 MCM2P49736 904 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 HS1BP3Q53T59 392 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 SBNO1A3KN83 1393 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 USP44Q9H0E7 712 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 MBD3O95983 291 aa21.02■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 STAP2Q9UGK3 403 aa21.02■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.02■□□□□ 0.96
PDE4A-201ENST00000293683 ANAPC15P60006 121 aa21.01■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.01■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 PTPRUQ92729 1446 aa21.01■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 IL17REQ8NFR9 667 aa21■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 DTNBO60941 627 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.98■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 USP48Q86UV5 1035 aa20.97■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.97■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 MPNDQ8N594 471 aa20.97■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 TSPY26PQ9H489 355 aa20.97■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.97■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC37A3O60309 1634 aa20.97■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 HSPA4P34932 840 aa20.96■□□□□ 0.95
PDE4A-201ENST00000293683 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms