RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
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TTLL1-201ENST00000266254 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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TTLL1-201ENST00000266254 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
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TTLL1-201ENST00000266254 LY75O60449 1722 aa29.19■■■□□ 2.26
TTLL1-201ENST00000266254 PAPPAQ13219 1627 aa29.19■■■□□ 2.26
TTLL1-201ENST00000266254 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.18■■■□□ 2.26
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TTLL1-201ENST00000266254 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.12■■■□□ 2.25
TTLL1-201ENST00000266254 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TTLL1-201ENST00000266254 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
TTLL1-201ENST00000266254 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.1■■■□□ 2.25
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