RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.75■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 IP6K1Q92551 441 aa23.73■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 KCNQ3O43525 872 aa23.72■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 PSME1Q06323 249 aa23.72■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.72■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.72■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 USP44Q9H0E7 712 aa23.72■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 SSFA2P28290 1259 aa23.71■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
LPCAT3-201ENST00000261407 ATP8B2P98198 1209 aa23.7■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 RABEP1Q15276 862 aa23.7■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.7■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 LTN1O94822 1766 aa23.7■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.69■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 GNAI3P08754 354 aa23.69■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 ORAI2Q96SN7 254 aa23.68■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.68■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.68■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 ANXA1P04083 346 aa23.68■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 CASC1Q6TDU7 716 aa23.68■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 FSD2A1L4K1 749 aa23.67■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.67■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 PANK2Q9BZ23 570 aa23.67■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.66■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.66■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 USP54Q70EL1 1684 aa23.66■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 NFAT5O94916 1531 aa23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 AK9Q5TCS8 1911 aa23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 ERC2O15083 957 aa23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 MX1P20591 662 aa23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 PKP1Q13835 747 aa23.64■■□□□ 1.38
LPCAT3-201ENST00000261407 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.64■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.64■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.64■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.63■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 GBP4Q96PP9 640 aa23.63■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 RILPL2Q969X0 211 aa23.63■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 REC8O95072 547 aa23.62■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 GCP02774 474 aa23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 BTBD11A6QL63 1104 aa23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.58■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 IL25Q9H293 177 aa23.58■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 PALD1Q9ULE6 856 aa23.58■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.58■■□□□ 1.37
LPCAT3-201ENST00000261407 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.58■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 TEFQ10587 303 aa23.58■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 SSH3Q8TE77 659 aa23.58■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.57■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 CACNA1FO60840 1977 aa23.57■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 CHMLP26374 656 aa23.57■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 ST18O60284 1047 aa23.56■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.56■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 BEND3Q5T5X7 828 aa23.56■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.56■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 PXDNQ92626 1479 aa23.56■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 SRGAP3O43295 1099 aa23.56■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 PROSER3Q2NL68 480 aa23.55■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.55■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 STAP2Q9UGK3 403 aa23.55■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 NEK4P51957 841 aa23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 POLA2Q14181 598 aa23.53■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.53■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.52■■□□□ 1.36
LPCAT3-201ENST00000261407 ADCY9O60503 1353 aa23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms