RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 IL16Q14005 1332 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 TNRQ92752 1358 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 PLCH2O75038 1416 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 SERPINC1P01008 464 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 SYCP1Q15431 976 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-201ENST00000254667 CBFA2T2O43439 604 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 ABCF2Q9UG63 623 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 FLIIQ13045 1269 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 NUP160Q12769 1436 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 EXOC5O00471 708 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 MAP3K12Q12852 859 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 ACEP12821 1306 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 SLC5A1P13866 664 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 PIK3R4Q99570 1358 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 MCM4P33991 863 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-201ENST00000254667 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ATP10BO94823 1461 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 TRIM27P14373 513 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 F6X3S4 739 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 NAPBQ9H115 298 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 A0A087WZG4 1122 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.153e-10■■■■■ 153.8
PTPRE-201ENST00000254667 A2MP01023 1474 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 USP5P45974 858 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 MAP7D2Q96T17 732 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 SMTNL1A8MU46 457 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 SLF2Q8IX21 1173 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ASXL2Q76L83 1435 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ADAMTS2O95450 1211 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 EVI5LQ96CN4 794 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 DEF6Q9H4E7 631 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF76P36508 570 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 SPC24Q8NBT2 197 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 IL27Q8NEV9 243 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 MBIPQ9NS73 344 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRE-201ENST00000254667 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms