RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 DPEP1P16444 411 aa23.46■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 FBLN1P23142 703 aa23.46■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.46■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 CYP27B1O15528 508 aa23.45■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 RRAGCQ9HB90 399 aa23.45■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.44■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 GNPATO15228 680 aa23.44■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 SIK1P57059 783 aa23.44■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 PIGBQ92521 554 aa23.44■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.44■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.43■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 KCNA3P22001 575 aa23.42■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 ITPK1Q13572 414 aa23.42■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.41■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 COG3Q96JB2 828 aa23.4■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 RNF181Q9P0P0 153 aa23.4■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.39■■□□□ 1.34
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF5Q96JK2 942 aa23.39■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.39■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.38■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.37■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 TMF1P82094 1093 aa23.35■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 KDRP35968 1356 aa23.34■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V1AP38606 617 aa23.33■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 PIM2Q9P1W9 311 aa23.33■■□□□ 1.33
SPCS1-201ENST00000233025 NCAPD2Q15021 1401 aa23.33■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 INSRP06213 1382 aa23.32■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 GYS1P13807 737 aa23.32■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.32■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.31■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.3■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.3■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.29■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.29■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.28■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.28■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 FLT4P35916 1363 aa23.27■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SPCS1-201ENST00000233025 ATG3Q9NT62 314 aa23.26■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.25■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 GLTPD2A6NH11 291 aa23.25■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 FOXN1O15353 648 aa23.25■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.25■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.25■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 RASSF7Q02833 373 aa23.24■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.24■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.23■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.23■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 CHRNA5P30532 468 aa23.22■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 RFC4P35249 363 aa23.21■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 DDR1Q08345 913 aa23.21■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 FAM161AQ3B820 660 aa23.21■■□□□ 1.31
SPCS1-201ENST00000233025 RPS6KA4O75676 772 aa23.2■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 CREBZFQ9NS37 354 aa23.2■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 SPG7Q9UQ90 795 aa23.2■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 POTECB2RU33 542 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 FYB1O15117 783 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 LMNB1P20700 586 aa23.18■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 TONSLQ96HA7 1378 aa23.17■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 TJP1Q07157 1748 aa23.16■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 CNTNAP1P78357 1384 aa23.16■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 PHKG2P15735 406 aa23.16■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.16■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP8Q14318 412 aa23.15■■□□□ 1.3
SPCS1-201ENST00000233025 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.13■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.13■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 TESK2Q96S53 571 aa23.12■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.11■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD8Q96I13 439 aa23.11■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.1■■□□□ 1.29
SPCS1-201ENST00000233025 CHADLQ6NUI6 762 aa23.09■■□□□ 1.29
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