RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 FLIIQ13045 1269 aa22.31■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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PANX1-201ENST00000227638 IL17REQ8NFR9 667 aa22.31■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.31■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.3■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 RABEP1Q15276 862 aa22.29■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 NEK4P51957 841 aa22.29■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 SSH2Q76I76 1423 aa22.29■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.28■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 STK31Q9BXU1 1019 aa22.28■■□□□ 1.16
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PANX1-201ENST00000227638 USP31Q70CQ4 1352 aa22.27■■□□□ 1.16
PANX1-201ENST00000227638 KCNQ3O43525 872 aa22.27■■□□□ 1.16
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PANX1-201ENST00000227638 KIAA0232Q92628 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
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PANX1-201ENST00000227638 LGR6Q9HBX8 967 aa22.24■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.24■■□□□ 1.15
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PANX1-201ENST00000227638 HMMRO75330 724 aa22.22■■□□□ 1.15
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PANX1-201ENST00000227638 CASC1Q6TDU7 716 aa22.22■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.22■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.22■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.22■■□□□ 1.15
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PANX1-201ENST00000227638 MX1P20591 662 aa22.21■■□□□ 1.15
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PANX1-201ENST00000227638 USP44Q9H0E7 712 aa22.21■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.21■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 SBNO1A3KN83 1393 aa22.21■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.21■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 GPT2Q8TD30 523 aa22.21■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PANX1-201ENST00000227638 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.2■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 TMX3Q96JJ7 454 aa22.2■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 ST18O60284 1047 aa22.2■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 PIK3C2AO00443 1686 aa22.19■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.19■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.19■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 ESPNB1AK53 854 aa22.19■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.19■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 REC8O95072 547 aa22.19■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.19■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF10O15013 1369 aa22.18■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.17■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 CPA1P15085 419 aa22.17■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.17■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 CHMLP26374 656 aa22.16■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.16■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 MPNDQ8N594 471 aa22.16■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.16■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.16■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 ATP8B2P98198 1209 aa22.16■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.16■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.16■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 RNF214Q8ND24 703 aa22.16■■□□□ 1.14
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PANX1-201ENST00000227638 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.14■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.14■■□□□ 1.14
PANX1-201ENST00000227638 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.14■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 CLCN1P35523 988 aa22.14■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.13■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.13■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 KDRP35968 1356 aa22.13■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 SYCE3A1L190 88 aa22.13■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 NUCB2P80303 420 aa22.13■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.12■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 SRGAP3O43295 1099 aa22.12■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.12■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 SPG7Q9UQ90 795 aa22.12■■□□□ 1.13
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