RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 EYA1Q99502 592 aa23.5■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 IFNL1Q8IU54 200 aa23.49■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.48■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.48■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.47■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDHB8Q9UN66 801 aa23.46■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.46■■□□□ 1.35
PLGRKT-201ENST00000223864 ITGB4P16144 1822 aa23.45■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 LY75O60449 1722 aa23.45■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 CYP27B1O15528 508 aa23.43■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 SPG7Q9UQ90 795 aa23.43■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 CASZ1Q86V15 1759 aa23.42■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.42■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 PAPPAQ13219 1627 aa23.41■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 STK32BQ9NY57 414 aa23.41■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.41■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.4■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.4■■□□□ 1.34
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC15A2Q16348 729 aa23.39■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.39■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.38■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 RGL2O15211 777 aa23.37■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.36■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 MTHFSP49914 203 aa23.35■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 SPON1Q9HCB6 807 aa23.35■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.35■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 POTEIP0CG38 1075 aa23.34■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.34■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 PHKG2P15735 406 aa23.33■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 IL13P35225 146 aa23.33■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 CLCN6P51797 869 aa23.33■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.33■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PLGRKT-201ENST00000223864 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.31■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.31■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF827Q17R98 1081 aa23.3■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.3■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 KDRP35968 1356 aa23.29■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNQ4P56696 695 aa23.29■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.29■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.29■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 C5P01031 1676 aa23.28■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PIGBQ92521 554 aa23.27■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PALLDQ8WX93 1383 aa23.27■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBTB7AO95365 584 aa23.26■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.25■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 MTFR1LQ9H019 292 aa23.24■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF5Q96JK2 942 aa23.23■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.22■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.22■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.22■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 PTGER2P43116 358 aa23.21■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PLGRKT-201ENST00000223864 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.2■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.2■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.2■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.19■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 HMOX1P09601 288 aa23.19■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 C4BP0C0L5 1744 aa23.19■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.18■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ATG3Q9NT62 314 aa23.17■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.16■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.16■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.16■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 SIK1P57059 783 aa23.16■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 CABP4P57796 275 aa23.15■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 CFAP53Q96M91 514 aa23.15■■□□□ 1.3
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP2R1AP30153 589 aa23.14■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.14■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.12■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP6V1AP38606 617 aa23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms