RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046174.7

Cldn11-201, Transcript of Claudin-11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn11, Length 1,870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa20.33■□□□□ 0.85
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Efcab2Q9CQ46 164 aa20.33■□□□□ 0.85
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Usp21Q9QZL6 566 aa20.33■□□□□ 0.85
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Ppm1fQ8CGA0 452 aa20.33■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Spata31d1bE9QA57 1361 aa20.32■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa20.32■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa20.32■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 PigbQ9JJQ0 542 aa20.32■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Plch1Q4KWH5 1682 aa20.31■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Apaf1O88879 1249 aa20.3■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Col4a1P02463 1669 aa20.3■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Magea6O89010 325 aa20.3■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Magea3Q6T340 320 aa20.3■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Ric1Q69ZJ7 1422 aa20.28■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 1810065E05RikQ5NC41 235 aa20.28■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa20.28■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Abcc12Q80WJ6 1366 aa20.26■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Slurp2P0DP59 97 aa20.26■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Wdr66E9Q743 1299 aa20.25■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Prim1P20664 417 aa20.25■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Nav1Q8CH77 1875 aa20.24■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa20.24■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Sgip1Q8VD37 806 aa20.24■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Zbtb1Q91VL9 713 aa20.24■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Btbd11Q6GQW0 1109 aa20.22■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Irx6Q9ER75 438 aa20.22■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Trip6Q9Z1Y4 480 aa20.22■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Zcwpw1Q6IR42 630 aa20.21■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Iqcf3Q9D498 203 aa20.21■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Myo5bP21271 1818 aa20.21■□□□□ 0.83
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Ggnbp2Q5SV77 696 aa20.2■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Amhr2Q8K592 568 aa20.2■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Tktl2Q9D4D4 627 aa20.2■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Adcy9P51830 1353 aa20.2■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 StrcQ8VIM6 1809 aa20.19■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Lrrc43Q3V0L5 667 aa20.19■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Atp1b3P97370 278 aa20.18■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Pde4dQ01063 747 aa20.18■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Camkk2Q8C078 588 aa20.18■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Exoc6Q8R313 802 aa20.16■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Ppef1O35655 650 aa20.16■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Egfem1Q8C088 590 aa20.16■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Strn4P58404 760 aa20.15■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Taf1dQ9D4V4 322 aa20.14■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Rnf180Q3U827 592 aa20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Cyp2c67Q569X9 491 aa20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Prkab2Q6PAM0 271 aa20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Gm12185Q5NCB2 835 aa20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Col4a5Q63ZW6 1691 aa20.12■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 MetP16056 1379 aa20.12■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Atf7ipQ7TT18 1306 aa20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Mylk2Q8VCR8 613 aa20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Klhdc4Q921I2 584 aa20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Cnnm1Q0GA42 951 aa20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Iqsec3Q3TES0 1195 aa20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Esx1O88933 382 aa20.1■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Slc39a6Q8C145 765 aa20.1■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Bcl2l13P59017 434 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Cyp2c69E9PXC3 491 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Cyp2c40P56657 491 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 EgfrQ01279 1210 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Gpr162Q3UN16 588 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Rapgefl1Q68EF8 662 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Kcnn1Q9EQR3 537 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Casz1Q9CWL2 1761 aa20.09■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Ubn2Q80WC1 1314 aa20.08■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Tgfb2P27090 414 aa20.08■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Ddx60E9PZQ1 1711 aa20.07■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Prr5lA2AVJ5 370 aa20.07■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Pibf1E9Q6K3 756 aa20.07■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Golgb1E9PVZ8 3238 aa20.07■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Zfyve9A2A8R0 1397 aa20.06■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Cavin4A2AMM0 362 aa20.06■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Tnnt1O88346 262 aa20.06■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Dusp27Q148W8 1138 aa20.06■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Dpf1Q9QX66 387 aa20.06■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Col1a2Q01149 1372 aa20.06■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa20.06■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Znf541Q0GGX2 1363 aa20.05■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Igfbp6P47880 238 aa20.05■□□□□ 0.8
Cldn11-201ENSMUST00000046174 Golga2Q921M4 999 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.8 ms