Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt4h1bQ9Z199 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt4h1bQ9Z199 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Supt4h1bQ9Z199 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Supt4h1bQ9Z199 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt4h1bQ9Z199 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Supt4h1bQ9Z199 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt4h1bQ9Z199 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt4h1bQ9Z199 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt4h1bQ9Z199 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Supt4h1bQ9Z199 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt4h1bQ9Z199 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt4h1bQ9Z199 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt4h1bQ9Z199 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Supt4h1bQ9Z199 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt4h1bQ9Z199 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt4h1bQ9Z199 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt4h1bQ9Z199 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt4h1bQ9Z199 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt4h1bQ9Z199 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt4h1bQ9Z199 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Supt4h1bQ9Z199 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt4h1bQ9Z199 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt4h1bQ9Z199 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Supt4h1bQ9Z199 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt4h1bQ9Z199 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt4h1bQ9Z199 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt4h1bQ9Z199 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Supt4h1bQ9Z199 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Supt4h1bQ9Z199 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt4h1bQ9Z199 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt4h1bQ9Z199 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt4h1bQ9Z199 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt4h1bQ9Z199 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt4h1bQ9Z199 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt4h1bQ9Z199 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Supt4h1bQ9Z199 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Supt4h1bQ9Z199 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Supt4h1bQ9Z199 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt4h1bQ9Z199 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Supt4h1bQ9Z199 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Supt4h1bQ9Z199 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt4h1bQ9Z199 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt4h1bQ9Z199 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt4h1bQ9Z199 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt4h1bQ9Z199 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt4h1bQ9Z199 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt4h1bQ9Z199 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt4h1bQ9Z199 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt4h1bQ9Z199 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt4h1bQ9Z199 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt4h1bQ9Z199 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt4h1bQ9Z199 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt4h1bQ9Z199 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt4h1bQ9Z199 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt4h1bQ9Z199 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt4h1bQ9Z199 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Supt4h1bQ9Z199 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Supt4h1bQ9Z199 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Supt4h1bQ9Z199 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Supt4h1bQ9Z199 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt4h1bQ9Z199 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt4h1bQ9Z199 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Supt4h1bQ9Z199 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Supt4h1bQ9Z199 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Supt4h1bQ9Z199 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Supt4h1bQ9Z199 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Supt4h1bQ9Z199 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Supt4h1bQ9Z199 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Supt4h1bQ9Z199 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt4h1bQ9Z199 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Supt4h1bQ9Z199 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Supt4h1bQ9Z199 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt4h1bQ9Z199 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt4h1bQ9Z199 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Supt4h1bQ9Z199 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Supt4h1bQ9Z199 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt4h1bQ9Z199 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt4h1bQ9Z199 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt4h1bQ9Z199 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt4h1bQ9Z199 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Supt4h1bQ9Z199 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Supt4h1bQ9Z199 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt4h1bQ9Z199 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt4h1bQ9Z199 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt4h1bQ9Z199 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt4h1bQ9Z199 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt4h1bQ9Z199 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt4h1bQ9Z199 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt4h1bQ9Z199 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt4h1bQ9Z199 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt4h1bQ9Z199 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt4h1bQ9Z199 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Supt4h1bQ9Z199 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Supt4h1bQ9Z199 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Supt4h1bQ9Z199 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Supt4h1bQ9Z199 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Supt4h1bQ9Z199 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Supt4h1bQ9Z199 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Supt4h1bQ9Z199 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms