Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Creb3l1Q9Z125 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Creb3l1Q9Z125 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Creb3l1Q9Z125 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Creb3l1Q9Z125 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Creb3l1Q9Z125 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Creb3l1Q9Z125 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Creb3l1Q9Z125 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Creb3l1Q9Z125 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Creb3l1Q9Z125 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Creb3l1Q9Z125 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Creb3l1Q9Z125 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Creb3l1Q9Z125 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Creb3l1Q9Z125 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Creb3l1Q9Z125 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Creb3l1Q9Z125 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Creb3l1Q9Z125 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Creb3l1Q9Z125 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Creb3l1Q9Z125 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Creb3l1Q9Z125 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Creb3l1Q9Z125 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Creb3l1Q9Z125 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Creb3l1Q9Z125 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Creb3l1Q9Z125 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Creb3l1Q9Z125 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Creb3l1Q9Z125 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Creb3l1Q9Z125 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Creb3l1Q9Z125 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Creb3l1Q9Z125 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Creb3l1Q9Z125 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Creb3l1Q9Z125 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Creb3l1Q9Z125 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Creb3l1Q9Z125 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Creb3l1Q9Z125 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Creb3l1Q9Z125 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Creb3l1Q9Z125 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Creb3l1Q9Z125 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Creb3l1Q9Z125 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Creb3l1Q9Z125 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Creb3l1Q9Z125 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Creb3l1Q9Z125 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Creb3l1Q9Z125 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Creb3l1Q9Z125 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Creb3l1Q9Z125 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Creb3l1Q9Z125 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Creb3l1Q9Z125 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Creb3l1Q9Z125 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Creb3l1Q9Z125 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Creb3l1Q9Z125 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Creb3l1Q9Z125 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Creb3l1Q9Z125 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Creb3l1Q9Z125 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Creb3l1Q9Z125 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Creb3l1Q9Z125 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Creb3l1Q9Z125 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Creb3l1Q9Z125 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Creb3l1Q9Z125 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Creb3l1Q9Z125 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Creb3l1Q9Z125 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Creb3l1Q9Z125 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Creb3l1Q9Z125 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Creb3l1Q9Z125 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Creb3l1Q9Z125 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Creb3l1Q9Z125 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Creb3l1Q9Z125 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Creb3l1Q9Z125 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Creb3l1Q9Z125 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Creb3l1Q9Z125 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Creb3l1Q9Z125 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Creb3l1Q9Z125 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Creb3l1Q9Z125 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Creb3l1Q9Z125 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Creb3l1Q9Z125 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Creb3l1Q9Z125 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Creb3l1Q9Z125 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Creb3l1Q9Z125 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Creb3l1Q9Z125 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Creb3l1Q9Z125 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Creb3l1Q9Z125 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Creb3l1Q9Z125 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Creb3l1Q9Z125 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Creb3l1Q9Z125 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Creb3l1Q9Z125 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Creb3l1Q9Z125 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3l1Q9Z125 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3l1Q9Z125 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Creb3l1Q9Z125 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Creb3l1Q9Z125 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Creb3l1Q9Z125 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Creb3l1Q9Z125 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Creb3l1Q9Z125 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Creb3l1Q9Z125 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Creb3l1Q9Z125 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Creb3l1Q9Z125 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Creb3l1Q9Z125 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Creb3l1Q9Z125 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Creb3l1Q9Z125 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Creb3l1Q9Z125 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Creb3l1Q9Z125 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Creb3l1Q9Z125 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms