Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Sh3glb1Q9JK48 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sh3glb1Q9JK48 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sh3glb1Q9JK48 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Sh3glb1Q9JK48 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sh3glb1Q9JK48 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Sh3glb1Q9JK48 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sh3glb1Q9JK48 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sh3glb1Q9JK48 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3glb1Q9JK48 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sh3glb1Q9JK48 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sh3glb1Q9JK48 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sh3glb1Q9JK48 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Sh3glb1Q9JK48 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sh3glb1Q9JK48 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sh3glb1Q9JK48 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3glb1Q9JK48 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sh3glb1Q9JK48 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sh3glb1Q9JK48 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3glb1Q9JK48 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3glb1Q9JK48 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3glb1Q9JK48 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3glb1Q9JK48 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3glb1Q9JK48 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3glb1Q9JK48 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3glb1Q9JK48 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3glb1Q9JK48 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3glb1Q9JK48 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh3glb1Q9JK48 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3glb1Q9JK48 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3glb1Q9JK48 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3glb1Q9JK48 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3glb1Q9JK48 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3glb1Q9JK48 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3glb1Q9JK48 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3glb1Q9JK48 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3glb1Q9JK48 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Sh3glb1Q9JK48 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3glb1Q9JK48 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3glb1Q9JK48 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3glb1Q9JK48 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3glb1Q9JK48 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3glb1Q9JK48 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3glb1Q9JK48 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3glb1Q9JK48 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3glb1Q9JK48 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3glb1Q9JK48 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3glb1Q9JK48 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3glb1Q9JK48 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3glb1Q9JK48 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3glb1Q9JK48 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3glb1Q9JK48 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3glb1Q9JK48 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3glb1Q9JK48 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3glb1Q9JK48 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3glb1Q9JK48 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3glb1Q9JK48 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3glb1Q9JK48 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3glb1Q9JK48 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3glb1Q9JK48 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3glb1Q9JK48 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3glb1Q9JK48 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3glb1Q9JK48 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3glb1Q9JK48 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3glb1Q9JK48 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3glb1Q9JK48 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3glb1Q9JK48 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3glb1Q9JK48 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3glb1Q9JK48 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3glb1Q9JK48 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3glb1Q9JK48 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3glb1Q9JK48 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3glb1Q9JK48 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3glb1Q9JK48 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3glb1Q9JK48 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3glb1Q9JK48 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sh3glb1Q9JK48 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3glb1Q9JK48 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3glb1Q9JK48 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3glb1Q9JK48 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3glb1Q9JK48 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3glb1Q9JK48 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3glb1Q9JK48 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3glb1Q9JK48 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3glb1Q9JK48 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3glb1Q9JK48 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3glb1Q9JK48 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3glb1Q9JK48 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3glb1Q9JK48 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3glb1Q9JK48 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3glb1Q9JK48 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms