Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Wdr61Q9ERF3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Wdr61Q9ERF3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Wdr61Q9ERF3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Wdr61Q9ERF3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Wdr61Q9ERF3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr61Q9ERF3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr61Q9ERF3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Wdr61Q9ERF3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Wdr61Q9ERF3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr61Q9ERF3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Wdr61Q9ERF3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Wdr61Q9ERF3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Wdr61Q9ERF3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Wdr61Q9ERF3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Wdr61Q9ERF3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr61Q9ERF3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Wdr61Q9ERF3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Wdr61Q9ERF3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr61Q9ERF3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr61Q9ERF3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Wdr61Q9ERF3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Wdr61Q9ERF3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr61Q9ERF3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr61Q9ERF3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Wdr61Q9ERF3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Wdr61Q9ERF3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Wdr61Q9ERF3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Wdr61Q9ERF3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Wdr61Q9ERF3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Wdr61Q9ERF3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr61Q9ERF3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Wdr61Q9ERF3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Wdr61Q9ERF3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Wdr61Q9ERF3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdr61Q9ERF3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdr61Q9ERF3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdr61Q9ERF3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdr61Q9ERF3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdr61Q9ERF3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Wdr61Q9ERF3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Wdr61Q9ERF3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Wdr61Q9ERF3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Wdr61Q9ERF3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Wdr61Q9ERF3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Wdr61Q9ERF3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Wdr61Q9ERF3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr61Q9ERF3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr61Q9ERF3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr61Q9ERF3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr61Q9ERF3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr61Q9ERF3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdr61Q9ERF3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wdr61Q9ERF3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Wdr61Q9ERF3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr61Q9ERF3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr61Q9ERF3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Wdr61Q9ERF3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Wdr61Q9ERF3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Wdr61Q9ERF3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr61Q9ERF3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Wdr61Q9ERF3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Wdr61Q9ERF3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr61Q9ERF3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Wdr61Q9ERF3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr61Q9ERF3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr61Q9ERF3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr61Q9ERF3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr61Q9ERF3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Wdr61Q9ERF3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Wdr61Q9ERF3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Wdr61Q9ERF3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Wdr61Q9ERF3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Wdr61Q9ERF3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Wdr61Q9ERF3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Wdr61Q9ERF3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Wdr61Q9ERF3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr61Q9ERF3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr61Q9ERF3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr61Q9ERF3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Wdr61Q9ERF3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Wdr61Q9ERF3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Wdr61Q9ERF3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wdr61Q9ERF3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wdr61Q9ERF3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr61Q9ERF3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr61Q9ERF3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr61Q9ERF3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr61Q9ERF3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr61Q9ERF3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Wdr61Q9ERF3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr61Q9ERF3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr61Q9ERF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr61Q9ERF3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr61Q9ERF3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr61Q9ERF3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr61Q9ERF3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
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