Protein–RNA interactions for Protein: Q9D583

4930503E14Rik, MCG118290, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930503E14RikQ9D583 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
4930503E14RikQ9D583 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930503E14RikQ9D583 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930503E14RikQ9D583 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930503E14RikQ9D583 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
4930503E14RikQ9D583 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930503E14RikQ9D583 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930503E14RikQ9D583 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930503E14RikQ9D583 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930503E14RikQ9D583 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930503E14RikQ9D583 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
4930503E14RikQ9D583 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
4930503E14RikQ9D583 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930503E14RikQ9D583 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
4930503E14RikQ9D583 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930503E14RikQ9D583 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930503E14RikQ9D583 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930503E14RikQ9D583 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
4930503E14RikQ9D583 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930503E14RikQ9D583 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930503E14RikQ9D583 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930503E14RikQ9D583 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930503E14RikQ9D583 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
4930503E14RikQ9D583 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930503E14RikQ9D583 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
4930503E14RikQ9D583 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930503E14RikQ9D583 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930503E14RikQ9D583 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930503E14RikQ9D583 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930503E14RikQ9D583 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930503E14RikQ9D583 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930503E14RikQ9D583 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930503E14RikQ9D583 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930503E14RikQ9D583 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930503E14RikQ9D583 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930503E14RikQ9D583 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930503E14RikQ9D583 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930503E14RikQ9D583 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930503E14RikQ9D583 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930503E14RikQ9D583 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930503E14RikQ9D583 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930503E14RikQ9D583 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930503E14RikQ9D583 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930503E14RikQ9D583 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930503E14RikQ9D583 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930503E14RikQ9D583 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
4930503E14RikQ9D583 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4930503E14RikQ9D583 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930503E14RikQ9D583 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930503E14RikQ9D583 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930503E14RikQ9D583 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930503E14RikQ9D583 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930503E14RikQ9D583 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930503E14RikQ9D583 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930503E14RikQ9D583 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930503E14RikQ9D583 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930503E14RikQ9D583 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930503E14RikQ9D583 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930503E14RikQ9D583 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930503E14RikQ9D583 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930503E14RikQ9D583 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930503E14RikQ9D583 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930503E14RikQ9D583 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4930503E14RikQ9D583 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930503E14RikQ9D583 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930503E14RikQ9D583 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930503E14RikQ9D583 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930503E14RikQ9D583 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930503E14RikQ9D583 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4930503E14RikQ9D583 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930503E14RikQ9D583 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930503E14RikQ9D583 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930503E14RikQ9D583 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930503E14RikQ9D583 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930503E14RikQ9D583 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930503E14RikQ9D583 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930503E14RikQ9D583 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930503E14RikQ9D583 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930503E14RikQ9D583 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930503E14RikQ9D583 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
4930503E14RikQ9D583 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930503E14RikQ9D583 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930503E14RikQ9D583 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930503E14RikQ9D583 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930503E14RikQ9D583 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930503E14RikQ9D583 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930503E14RikQ9D583 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930503E14RikQ9D583 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930503E14RikQ9D583 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930503E14RikQ9D583 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930503E14RikQ9D583 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930503E14RikQ9D583 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930503E14RikQ9D583 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
4930503E14RikQ9D583 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930503E14RikQ9D583 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930503E14RikQ9D583 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930503E14RikQ9D583 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930503E14RikQ9D583 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930503E14RikQ9D583 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930503E14RikQ9D583 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms