Protein–RNA interactions for Protein: Q9D410

Dmrtc1c1, DMRT-like family C1c1, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dmrtc1c1Q9D410 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dmrtc1c1Q9D410 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Dmrtc1c1Q9D410 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dmrtc1c1Q9D410 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dmrtc1c1Q9D410 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dmrtc1c1Q9D410 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Dmrtc1c1Q9D410 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dmrtc1c1Q9D410 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dmrtc1c1Q9D410 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dmrtc1c1Q9D410 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dmrtc1c1Q9D410 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dmrtc1c1Q9D410 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dmrtc1c1Q9D410 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dmrtc1c1Q9D410 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dmrtc1c1Q9D410 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dmrtc1c1Q9D410 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dmrtc1c1Q9D410 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dmrtc1c1Q9D410 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dmrtc1c1Q9D410 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dmrtc1c1Q9D410 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dmrtc1c1Q9D410 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dmrtc1c1Q9D410 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dmrtc1c1Q9D410 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dmrtc1c1Q9D410 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dmrtc1c1Q9D410 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dmrtc1c1Q9D410 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dmrtc1c1Q9D410 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dmrtc1c1Q9D410 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dmrtc1c1Q9D410 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dmrtc1c1Q9D410 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dmrtc1c1Q9D410 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dmrtc1c1Q9D410 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dmrtc1c1Q9D410 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dmrtc1c1Q9D410 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dmrtc1c1Q9D410 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dmrtc1c1Q9D410 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dmrtc1c1Q9D410 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dmrtc1c1Q9D410 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dmrtc1c1Q9D410 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dmrtc1c1Q9D410 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dmrtc1c1Q9D410 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Dmrtc1c1Q9D410 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dmrtc1c1Q9D410 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dmrtc1c1Q9D410 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Dmrtc1c1Q9D410 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dmrtc1c1Q9D410 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dmrtc1c1Q9D410 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dmrtc1c1Q9D410 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dmrtc1c1Q9D410 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dmrtc1c1Q9D410 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dmrtc1c1Q9D410 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dmrtc1c1Q9D410 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dmrtc1c1Q9D410 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dmrtc1c1Q9D410 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmrtc1c1Q9D410 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmrtc1c1Q9D410 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmrtc1c1Q9D410 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmrtc1c1Q9D410 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmrtc1c1Q9D410 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmrtc1c1Q9D410 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmrtc1c1Q9D410 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmrtc1c1Q9D410 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmrtc1c1Q9D410 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmrtc1c1Q9D410 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmrtc1c1Q9D410 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmrtc1c1Q9D410 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmrtc1c1Q9D410 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmrtc1c1Q9D410 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dmrtc1c1Q9D410 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dmrtc1c1Q9D410 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dmrtc1c1Q9D410 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dmrtc1c1Q9D410 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dmrtc1c1Q9D410 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dmrtc1c1Q9D410 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dmrtc1c1Q9D410 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dmrtc1c1Q9D410 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dmrtc1c1Q9D410 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dmrtc1c1Q9D410 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dmrtc1c1Q9D410 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dmrtc1c1Q9D410 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dmrtc1c1Q9D410 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dmrtc1c1Q9D410 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dmrtc1c1Q9D410 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dmrtc1c1Q9D410 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dmrtc1c1Q9D410 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dmrtc1c1Q9D410 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmrtc1c1Q9D410 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmrtc1c1Q9D410 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmrtc1c1Q9D410 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dmrtc1c1Q9D410 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dmrtc1c1Q9D410 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dmrtc1c1Q9D410 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dmrtc1c1Q9D410 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dmrtc1c1Q9D410 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dmrtc1c1Q9D410 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dmrtc1c1Q9D410 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dmrtc1c1Q9D410 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dmrtc1c1Q9D410 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dmrtc1c1Q9D410 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dmrtc1c1Q9D410 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms