Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X5

Pacrgl, PACRG-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrglQ9D3X5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PacrglQ9D3X5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PacrglQ9D3X5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PacrglQ9D3X5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PacrglQ9D3X5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PacrglQ9D3X5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PacrglQ9D3X5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PacrglQ9D3X5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PacrglQ9D3X5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PacrglQ9D3X5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PacrglQ9D3X5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PacrglQ9D3X5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PacrglQ9D3X5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PacrglQ9D3X5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PacrglQ9D3X5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PacrglQ9D3X5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PacrglQ9D3X5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PacrglQ9D3X5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PacrglQ9D3X5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PacrglQ9D3X5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PacrglQ9D3X5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PacrglQ9D3X5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PacrglQ9D3X5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PacrglQ9D3X5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PacrglQ9D3X5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PacrglQ9D3X5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PacrglQ9D3X5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PacrglQ9D3X5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PacrglQ9D3X5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PacrglQ9D3X5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PacrglQ9D3X5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PacrglQ9D3X5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PacrglQ9D3X5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PacrglQ9D3X5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PacrglQ9D3X5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PacrglQ9D3X5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PacrglQ9D3X5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PacrglQ9D3X5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PacrglQ9D3X5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PacrglQ9D3X5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PacrglQ9D3X5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PacrglQ9D3X5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PacrglQ9D3X5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PacrglQ9D3X5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PacrglQ9D3X5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PacrglQ9D3X5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PacrglQ9D3X5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PacrglQ9D3X5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PacrglQ9D3X5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PacrglQ9D3X5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PacrglQ9D3X5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PacrglQ9D3X5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PacrglQ9D3X5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PacrglQ9D3X5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PacrglQ9D3X5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PacrglQ9D3X5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PacrglQ9D3X5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PacrglQ9D3X5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PacrglQ9D3X5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PacrglQ9D3X5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PacrglQ9D3X5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PacrglQ9D3X5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PacrglQ9D3X5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PacrglQ9D3X5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PacrglQ9D3X5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PacrglQ9D3X5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PacrglQ9D3X5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PacrglQ9D3X5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PacrglQ9D3X5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PacrglQ9D3X5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PacrglQ9D3X5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PacrglQ9D3X5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PacrglQ9D3X5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PacrglQ9D3X5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PacrglQ9D3X5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PacrglQ9D3X5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PacrglQ9D3X5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PacrglQ9D3X5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PacrglQ9D3X5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PacrglQ9D3X5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PacrglQ9D3X5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PacrglQ9D3X5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PacrglQ9D3X5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PacrglQ9D3X5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PacrglQ9D3X5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PacrglQ9D3X5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PacrglQ9D3X5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PacrglQ9D3X5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PacrglQ9D3X5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PacrglQ9D3X5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PacrglQ9D3X5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PacrglQ9D3X5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PacrglQ9D3X5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PacrglQ9D3X5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PacrglQ9D3X5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PacrglQ9D3X5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PacrglQ9D3X5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PacrglQ9D3X5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PacrglQ9D3X5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PacrglQ9D3X5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms