Protein–RNA interactions for Protein: Q9D306

Mgat4c, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat4cQ9D306 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mgat4cQ9D306 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mgat4cQ9D306 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mgat4cQ9D306 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mgat4cQ9D306 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mgat4cQ9D306 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mgat4cQ9D306 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mgat4cQ9D306 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mgat4cQ9D306 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mgat4cQ9D306 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mgat4cQ9D306 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mgat4cQ9D306 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mgat4cQ9D306 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mgat4cQ9D306 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mgat4cQ9D306 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mgat4cQ9D306 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mgat4cQ9D306 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mgat4cQ9D306 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mgat4cQ9D306 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mgat4cQ9D306 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mgat4cQ9D306 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mgat4cQ9D306 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mgat4cQ9D306 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mgat4cQ9D306 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mgat4cQ9D306 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mgat4cQ9D306 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mgat4cQ9D306 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mgat4cQ9D306 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mgat4cQ9D306 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat4cQ9D306 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat4cQ9D306 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mgat4cQ9D306 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mgat4cQ9D306 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mgat4cQ9D306 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mgat4cQ9D306 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mgat4cQ9D306 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mgat4cQ9D306 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mgat4cQ9D306 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Mgat4cQ9D306 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mgat4cQ9D306 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mgat4cQ9D306 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mgat4cQ9D306 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mgat4cQ9D306 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mgat4cQ9D306 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mgat4cQ9D306 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mgat4cQ9D306 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mgat4cQ9D306 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mgat4cQ9D306 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mgat4cQ9D306 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mgat4cQ9D306 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mgat4cQ9D306 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mgat4cQ9D306 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mgat4cQ9D306 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mgat4cQ9D306 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mgat4cQ9D306 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mgat4cQ9D306 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mgat4cQ9D306 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mgat4cQ9D306 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mgat4cQ9D306 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mgat4cQ9D306 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mgat4cQ9D306 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mgat4cQ9D306 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mgat4cQ9D306 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mgat4cQ9D306 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mgat4cQ9D306 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mgat4cQ9D306 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mgat4cQ9D306 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mgat4cQ9D306 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mgat4cQ9D306 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mgat4cQ9D306 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mgat4cQ9D306 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mgat4cQ9D306 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mgat4cQ9D306 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mgat4cQ9D306 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mgat4cQ9D306 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mgat4cQ9D306 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mgat4cQ9D306 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mgat4cQ9D306 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mgat4cQ9D306 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mgat4cQ9D306 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mgat4cQ9D306 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mgat4cQ9D306 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mgat4cQ9D306 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mgat4cQ9D306 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mgat4cQ9D306 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mgat4cQ9D306 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mgat4cQ9D306 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mgat4cQ9D306 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mgat4cQ9D306 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mgat4cQ9D306 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mgat4cQ9D306 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mgat4cQ9D306 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mgat4cQ9D306 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mgat4cQ9D306 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mgat4cQ9D306 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mgat4cQ9D306 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mgat4cQ9D306 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mgat4cQ9D306 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mgat4cQ9D306 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mgat4cQ9D306 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms