Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R9

Wdr89, WD repeat-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr89Q9D0R9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Wdr89Q9D0R9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Wdr89Q9D0R9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Wdr89Q9D0R9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Wdr89Q9D0R9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Wdr89Q9D0R9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Wdr89Q9D0R9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Wdr89Q9D0R9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Wdr89Q9D0R9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Wdr89Q9D0R9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Wdr89Q9D0R9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Wdr89Q9D0R9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Wdr89Q9D0R9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Wdr89Q9D0R9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdr89Q9D0R9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdr89Q9D0R9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr89Q9D0R9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr89Q9D0R9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdr89Q9D0R9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Wdr89Q9D0R9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Wdr89Q9D0R9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Wdr89Q9D0R9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdr89Q9D0R9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdr89Q9D0R9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdr89Q9D0R9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Wdr89Q9D0R9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Wdr89Q9D0R9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Wdr89Q9D0R9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Wdr89Q9D0R9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Wdr89Q9D0R9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Wdr89Q9D0R9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Wdr89Q9D0R9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Wdr89Q9D0R9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Wdr89Q9D0R9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr89Q9D0R9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr89Q9D0R9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr89Q9D0R9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Wdr89Q9D0R9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Wdr89Q9D0R9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Wdr89Q9D0R9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Wdr89Q9D0R9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Wdr89Q9D0R9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Wdr89Q9D0R9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Wdr89Q9D0R9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Wdr89Q9D0R9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wdr89Q9D0R9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wdr89Q9D0R9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wdr89Q9D0R9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Wdr89Q9D0R9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr89Q9D0R9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr89Q9D0R9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr89Q9D0R9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Wdr89Q9D0R9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Wdr89Q9D0R9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Wdr89Q9D0R9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Wdr89Q9D0R9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr89Q9D0R9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Wdr89Q9D0R9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Wdr89Q9D0R9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Wdr89Q9D0R9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Wdr89Q9D0R9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr89Q9D0R9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr89Q9D0R9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr89Q9D0R9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Wdr89Q9D0R9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Wdr89Q9D0R9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Wdr89Q9D0R9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr89Q9D0R9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr89Q9D0R9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr89Q9D0R9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr89Q9D0R9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr89Q9D0R9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr89Q9D0R9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr89Q9D0R9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr89Q9D0R9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Wdr89Q9D0R9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Wdr89Q9D0R9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Wdr89Q9D0R9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr89Q9D0R9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Wdr89Q9D0R9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr89Q9D0R9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wdr89Q9D0R9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wdr89Q9D0R9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdr89Q9D0R9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdr89Q9D0R9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdr89Q9D0R9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdr89Q9D0R9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Wdr89Q9D0R9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdr89Q9D0R9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdr89Q9D0R9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr89Q9D0R9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Wdr89Q9D0R9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Wdr89Q9D0R9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Wdr89Q9D0R9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Wdr89Q9D0R9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Wdr89Q9D0R9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Wdr89Q9D0R9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr89Q9D0R9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr89Q9D0R9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr89Q9D0R9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms