Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChtopQ9CY57 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChtopQ9CY57 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChtopQ9CY57 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChtopQ9CY57 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ChtopQ9CY57 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChtopQ9CY57 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ChtopQ9CY57 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChtopQ9CY57 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChtopQ9CY57 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChtopQ9CY57 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChtopQ9CY57 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChtopQ9CY57 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChtopQ9CY57 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChtopQ9CY57 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChtopQ9CY57 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChtopQ9CY57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChtopQ9CY57 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ChtopQ9CY57 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChtopQ9CY57 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChtopQ9CY57 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChtopQ9CY57 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChtopQ9CY57 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChtopQ9CY57 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChtopQ9CY57 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ChtopQ9CY57 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChtopQ9CY57 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChtopQ9CY57 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChtopQ9CY57 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChtopQ9CY57 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChtopQ9CY57 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChtopQ9CY57 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChtopQ9CY57 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ChtopQ9CY57 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChtopQ9CY57 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ChtopQ9CY57 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChtopQ9CY57 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChtopQ9CY57 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ChtopQ9CY57 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChtopQ9CY57 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChtopQ9CY57 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChtopQ9CY57 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChtopQ9CY57 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChtopQ9CY57 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChtopQ9CY57 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChtopQ9CY57 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChtopQ9CY57 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChtopQ9CY57 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChtopQ9CY57 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChtopQ9CY57 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChtopQ9CY57 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChtopQ9CY57 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ChtopQ9CY57 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChtopQ9CY57 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ChtopQ9CY57 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ChtopQ9CY57 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChtopQ9CY57 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChtopQ9CY57 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChtopQ9CY57 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChtopQ9CY57 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChtopQ9CY57 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChtopQ9CY57 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChtopQ9CY57 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChtopQ9CY57 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChtopQ9CY57 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChtopQ9CY57 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChtopQ9CY57 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChtopQ9CY57 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ChtopQ9CY57 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChtopQ9CY57 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChtopQ9CY57 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChtopQ9CY57 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChtopQ9CY57 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChtopQ9CY57 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChtopQ9CY57 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChtopQ9CY57 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChtopQ9CY57 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChtopQ9CY57 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChtopQ9CY57 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChtopQ9CY57 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChtopQ9CY57 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChtopQ9CY57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChtopQ9CY57 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChtopQ9CY57 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChtopQ9CY57 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ChtopQ9CY57 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChtopQ9CY57 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChtopQ9CY57 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ChtopQ9CY57 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChtopQ9CY57 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChtopQ9CY57 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChtopQ9CY57 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChtopQ9CY57 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ChtopQ9CY57 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ChtopQ9CY57 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ChtopQ9CY57 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ChtopQ9CY57 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChtopQ9CY57 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChtopQ9CY57 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChtopQ9CY57 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms