Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sntg1Q925E1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sntg1Q925E1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sntg1Q925E1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sntg1Q925E1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sntg1Q925E1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sntg1Q925E1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sntg1Q925E1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sntg1Q925E1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sntg1Q925E1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sntg1Q925E1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sntg1Q925E1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sntg1Q925E1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sntg1Q925E1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sntg1Q925E1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sntg1Q925E1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sntg1Q925E1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sntg1Q925E1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sntg1Q925E1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sntg1Q925E1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sntg1Q925E1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sntg1Q925E1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sntg1Q925E1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sntg1Q925E1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sntg1Q925E1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sntg1Q925E1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sntg1Q925E1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sntg1Q925E1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sntg1Q925E1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sntg1Q925E1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sntg1Q925E1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sntg1Q925E1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sntg1Q925E1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Sntg1Q925E1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sntg1Q925E1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sntg1Q925E1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sntg1Q925E1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sntg1Q925E1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sntg1Q925E1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sntg1Q925E1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sntg1Q925E1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sntg1Q925E1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sntg1Q925E1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sntg1Q925E1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sntg1Q925E1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sntg1Q925E1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sntg1Q925E1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sntg1Q925E1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sntg1Q925E1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sntg1Q925E1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sntg1Q925E1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sntg1Q925E1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sntg1Q925E1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sntg1Q925E1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sntg1Q925E1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sntg1Q925E1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sntg1Q925E1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sntg1Q925E1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sntg1Q925E1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sntg1Q925E1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sntg1Q925E1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sntg1Q925E1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sntg1Q925E1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sntg1Q925E1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sntg1Q925E1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sntg1Q925E1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sntg1Q925E1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sntg1Q925E1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sntg1Q925E1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sntg1Q925E1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sntg1Q925E1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sntg1Q925E1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sntg1Q925E1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sntg1Q925E1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sntg1Q925E1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sntg1Q925E1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sntg1Q925E1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sntg1Q925E1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sntg1Q925E1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sntg1Q925E1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sntg1Q925E1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sntg1Q925E1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sntg1Q925E1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sntg1Q925E1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sntg1Q925E1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sntg1Q925E1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sntg1Q925E1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sntg1Q925E1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sntg1Q925E1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sntg1Q925E1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sntg1Q925E1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sntg1Q925E1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sntg1Q925E1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sntg1Q925E1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sntg1Q925E1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sntg1Q925E1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg1Q925E1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sntg1Q925E1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sntg1Q925E1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sntg1Q925E1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms