Protein–RNA interactions for Protein: Q924P3

Lcn8, Epididymal-specific lipocalin-8, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn8Q924P3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lcn8Q924P3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lcn8Q924P3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lcn8Q924P3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lcn8Q924P3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lcn8Q924P3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lcn8Q924P3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lcn8Q924P3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lcn8Q924P3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lcn8Q924P3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lcn8Q924P3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lcn8Q924P3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lcn8Q924P3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lcn8Q924P3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lcn8Q924P3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lcn8Q924P3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lcn8Q924P3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lcn8Q924P3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lcn8Q924P3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lcn8Q924P3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lcn8Q924P3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lcn8Q924P3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lcn8Q924P3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lcn8Q924P3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lcn8Q924P3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lcn8Q924P3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lcn8Q924P3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lcn8Q924P3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn8Q924P3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lcn8Q924P3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lcn8Q924P3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lcn8Q924P3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lcn8Q924P3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lcn8Q924P3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lcn8Q924P3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lcn8Q924P3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lcn8Q924P3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lcn8Q924P3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lcn8Q924P3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lcn8Q924P3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lcn8Q924P3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lcn8Q924P3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lcn8Q924P3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcn8Q924P3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcn8Q924P3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcn8Q924P3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn8Q924P3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lcn8Q924P3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcn8Q924P3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn8Q924P3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lcn8Q924P3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lcn8Q924P3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcn8Q924P3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lcn8Q924P3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcn8Q924P3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lcn8Q924P3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcn8Q924P3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lcn8Q924P3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcn8Q924P3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lcn8Q924P3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lcn8Q924P3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn8Q924P3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lcn8Q924P3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lcn8Q924P3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lcn8Q924P3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lcn8Q924P3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lcn8Q924P3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lcn8Q924P3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lcn8Q924P3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lcn8Q924P3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lcn8Q924P3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lcn8Q924P3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lcn8Q924P3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lcn8Q924P3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lcn8Q924P3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lcn8Q924P3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lcn8Q924P3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn8Q924P3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lcn8Q924P3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lcn8Q924P3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lcn8Q924P3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lcn8Q924P3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lcn8Q924P3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lcn8Q924P3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn8Q924P3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn8Q924P3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn8Q924P3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcn8Q924P3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn8Q924P3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn8Q924P3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcn8Q924P3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcn8Q924P3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcn8Q924P3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcn8Q924P3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcn8Q924P3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lcn8Q924P3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcn8Q924P3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn8Q924P3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lcn8Q924P3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcn8Q924P3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms