Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trpm8Q8R4D5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trpm8Q8R4D5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trpm8Q8R4D5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trpm8Q8R4D5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Trpm8Q8R4D5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Trpm8Q8R4D5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trpm8Q8R4D5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trpm8Q8R4D5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trpm8Q8R4D5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trpm8Q8R4D5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trpm8Q8R4D5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Trpm8Q8R4D5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Trpm8Q8R4D5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Trpm8Q8R4D5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trpm8Q8R4D5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trpm8Q8R4D5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trpm8Q8R4D5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Trpm8Q8R4D5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpm8Q8R4D5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trpm8Q8R4D5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trpm8Q8R4D5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpm8Q8R4D5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm8Q8R4D5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm8Q8R4D5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm8Q8R4D5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm8Q8R4D5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm8Q8R4D5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trpm8Q8R4D5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm8Q8R4D5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpm8Q8R4D5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpm8Q8R4D5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trpm8Q8R4D5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trpm8Q8R4D5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trpm8Q8R4D5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Trpm8Q8R4D5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpm8Q8R4D5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trpm8Q8R4D5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Trpm8Q8R4D5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm8Q8R4D5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm8Q8R4D5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm8Q8R4D5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpm8Q8R4D5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm8Q8R4D5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpm8Q8R4D5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm8Q8R4D5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm8Q8R4D5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm8Q8R4D5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm8Q8R4D5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trpm8Q8R4D5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm8Q8R4D5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm8Q8R4D5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm8Q8R4D5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm8Q8R4D5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm8Q8R4D5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm8Q8R4D5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm8Q8R4D5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm8Q8R4D5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm8Q8R4D5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm8Q8R4D5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm8Q8R4D5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm8Q8R4D5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm8Q8R4D5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm8Q8R4D5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm8Q8R4D5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm8Q8R4D5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm8Q8R4D5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm8Q8R4D5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm8Q8R4D5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm8Q8R4D5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm8Q8R4D5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm8Q8R4D5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm8Q8R4D5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm8Q8R4D5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm8Q8R4D5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm8Q8R4D5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm8Q8R4D5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm8Q8R4D5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm8Q8R4D5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm8Q8R4D5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm8Q8R4D5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm8Q8R4D5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm8Q8R4D5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm8Q8R4D5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm8Q8R4D5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm8Q8R4D5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm8Q8R4D5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm8Q8R4D5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm8Q8R4D5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm8Q8R4D5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm8Q8R4D5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm8Q8R4D5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm8Q8R4D5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpm8Q8R4D5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpm8Q8R4D5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpm8Q8R4D5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm8Q8R4D5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm8Q8R4D5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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