Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
0610009B22RikQ8R3W2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
0610009B22RikQ8R3W2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
0610009B22RikQ8R3W2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
0610009B22RikQ8R3W2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
0610009B22RikQ8R3W2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
0610009B22RikQ8R3W2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
0610009B22RikQ8R3W2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
0610009B22RikQ8R3W2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
0610009B22RikQ8R3W2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
0610009B22RikQ8R3W2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
0610009B22RikQ8R3W2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
0610009B22RikQ8R3W2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
0610009B22RikQ8R3W2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
0610009B22RikQ8R3W2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
0610009B22RikQ8R3W2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
0610009B22RikQ8R3W2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
0610009B22RikQ8R3W2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
0610009B22RikQ8R3W2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
0610009B22RikQ8R3W2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
0610009B22RikQ8R3W2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610009B22RikQ8R3W2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
0610009B22RikQ8R3W2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
0610009B22RikQ8R3W2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
0610009B22RikQ8R3W2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
0610009B22RikQ8R3W2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
0610009B22RikQ8R3W2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
0610009B22RikQ8R3W2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
0610009B22RikQ8R3W2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
0610009B22RikQ8R3W2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
0610009B22RikQ8R3W2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
0610009B22RikQ8R3W2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
0610009B22RikQ8R3W2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
0610009B22RikQ8R3W2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
0610009B22RikQ8R3W2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
0610009B22RikQ8R3W2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
0610009B22RikQ8R3W2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
0610009B22RikQ8R3W2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
0610009B22RikQ8R3W2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
0610009B22RikQ8R3W2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
0610009B22RikQ8R3W2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
0610009B22RikQ8R3W2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
0610009B22RikQ8R3W2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
0610009B22RikQ8R3W2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
0610009B22RikQ8R3W2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
0610009B22RikQ8R3W2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
0610009B22RikQ8R3W2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
0610009B22RikQ8R3W2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
0610009B22RikQ8R3W2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
0610009B22RikQ8R3W2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
0610009B22RikQ8R3W2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
0610009B22RikQ8R3W2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
0610009B22RikQ8R3W2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
0610009B22RikQ8R3W2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
0610009B22RikQ8R3W2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
0610009B22RikQ8R3W2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
0610009B22RikQ8R3W2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
0610009B22RikQ8R3W2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
0610009B22RikQ8R3W2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
0610009B22RikQ8R3W2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
0610009B22RikQ8R3W2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
0610009B22RikQ8R3W2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
0610009B22RikQ8R3W2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
0610009B22RikQ8R3W2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
0610009B22RikQ8R3W2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
0610009B22RikQ8R3W2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
0610009B22RikQ8R3W2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
0610009B22RikQ8R3W2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
0610009B22RikQ8R3W2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
0610009B22RikQ8R3W2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
0610009B22RikQ8R3W2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
0610009B22RikQ8R3W2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
0610009B22RikQ8R3W2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
0610009B22RikQ8R3W2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
0610009B22RikQ8R3W2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
0610009B22RikQ8R3W2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
0610009B22RikQ8R3W2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
0610009B22RikQ8R3W2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
0610009B22RikQ8R3W2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms