Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RorbQ8R1B8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RorbQ8R1B8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RorbQ8R1B8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RorbQ8R1B8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RorbQ8R1B8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RorbQ8R1B8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RorbQ8R1B8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RorbQ8R1B8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RorbQ8R1B8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RorbQ8R1B8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RorbQ8R1B8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RorbQ8R1B8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RorbQ8R1B8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RorbQ8R1B8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RorbQ8R1B8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RorbQ8R1B8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RorbQ8R1B8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RorbQ8R1B8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RorbQ8R1B8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RorbQ8R1B8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RorbQ8R1B8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RorbQ8R1B8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RorbQ8R1B8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RorbQ8R1B8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RorbQ8R1B8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RorbQ8R1B8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RorbQ8R1B8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RorbQ8R1B8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RorbQ8R1B8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RorbQ8R1B8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RorbQ8R1B8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RorbQ8R1B8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RorbQ8R1B8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RorbQ8R1B8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RorbQ8R1B8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RorbQ8R1B8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
RorbQ8R1B8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RorbQ8R1B8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RorbQ8R1B8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RorbQ8R1B8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RorbQ8R1B8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RorbQ8R1B8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RorbQ8R1B8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RorbQ8R1B8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RorbQ8R1B8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RorbQ8R1B8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RorbQ8R1B8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RorbQ8R1B8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RorbQ8R1B8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RorbQ8R1B8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RorbQ8R1B8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RorbQ8R1B8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RorbQ8R1B8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RorbQ8R1B8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RorbQ8R1B8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RorbQ8R1B8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RorbQ8R1B8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RorbQ8R1B8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RorbQ8R1B8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RorbQ8R1B8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RorbQ8R1B8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RorbQ8R1B8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RorbQ8R1B8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RorbQ8R1B8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RorbQ8R1B8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RorbQ8R1B8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RorbQ8R1B8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RorbQ8R1B8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RorbQ8R1B8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RorbQ8R1B8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RorbQ8R1B8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RorbQ8R1B8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RorbQ8R1B8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RorbQ8R1B8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RorbQ8R1B8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
RorbQ8R1B8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RorbQ8R1B8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RorbQ8R1B8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RorbQ8R1B8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RorbQ8R1B8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RorbQ8R1B8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RorbQ8R1B8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RorbQ8R1B8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RorbQ8R1B8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RorbQ8R1B8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RorbQ8R1B8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RorbQ8R1B8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RorbQ8R1B8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RorbQ8R1B8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RorbQ8R1B8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RorbQ8R1B8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RorbQ8R1B8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RorbQ8R1B8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RorbQ8R1B8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RorbQ8R1B8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RorbQ8R1B8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RorbQ8R1B8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RorbQ8R1B8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RorbQ8R1B8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms