Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG0

Panx3, Pannexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Panx3Q8CEG0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Panx3Q8CEG0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Panx3Q8CEG0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Panx3Q8CEG0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Panx3Q8CEG0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Panx3Q8CEG0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Panx3Q8CEG0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Panx3Q8CEG0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Panx3Q8CEG0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Panx3Q8CEG0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Panx3Q8CEG0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Panx3Q8CEG0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Panx3Q8CEG0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Panx3Q8CEG0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Panx3Q8CEG0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Panx3Q8CEG0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Panx3Q8CEG0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Panx3Q8CEG0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Panx3Q8CEG0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Panx3Q8CEG0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Panx3Q8CEG0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Panx3Q8CEG0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Panx3Q8CEG0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Panx3Q8CEG0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Panx3Q8CEG0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Panx3Q8CEG0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Panx3Q8CEG0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Panx3Q8CEG0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Panx3Q8CEG0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Panx3Q8CEG0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Panx3Q8CEG0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Panx3Q8CEG0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Panx3Q8CEG0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Panx3Q8CEG0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Panx3Q8CEG0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Panx3Q8CEG0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Panx3Q8CEG0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Panx3Q8CEG0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Panx3Q8CEG0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Panx3Q8CEG0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Panx3Q8CEG0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Panx3Q8CEG0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Panx3Q8CEG0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Panx3Q8CEG0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Panx3Q8CEG0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Panx3Q8CEG0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Panx3Q8CEG0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Panx3Q8CEG0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Panx3Q8CEG0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Panx3Q8CEG0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Panx3Q8CEG0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Panx3Q8CEG0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Panx3Q8CEG0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Panx3Q8CEG0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Panx3Q8CEG0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Panx3Q8CEG0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Panx3Q8CEG0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Panx3Q8CEG0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Panx3Q8CEG0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Panx3Q8CEG0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Panx3Q8CEG0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Panx3Q8CEG0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Panx3Q8CEG0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Panx3Q8CEG0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Panx3Q8CEG0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Panx3Q8CEG0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Panx3Q8CEG0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Panx3Q8CEG0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Panx3Q8CEG0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Panx3Q8CEG0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Panx3Q8CEG0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Panx3Q8CEG0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Panx3Q8CEG0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Panx3Q8CEG0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Panx3Q8CEG0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Panx3Q8CEG0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Panx3Q8CEG0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Panx3Q8CEG0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Panx3Q8CEG0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Panx3Q8CEG0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Panx3Q8CEG0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Panx3Q8CEG0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Panx3Q8CEG0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Panx3Q8CEG0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Panx3Q8CEG0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Panx3Q8CEG0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Panx3Q8CEG0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Panx3Q8CEG0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Panx3Q8CEG0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Panx3Q8CEG0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Panx3Q8CEG0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Panx3Q8CEG0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Panx3Q8CEG0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Panx3Q8CEG0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Panx3Q8CEG0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Panx3Q8CEG0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Panx3Q8CEG0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Panx3Q8CEG0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Panx3Q8CEG0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Panx3Q8CEG0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms