Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSE6

Stk38l, Serine/threonine-protein kinase 38-like, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk38lQ7TSE6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Stk38lQ7TSE6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Stk38lQ7TSE6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Stk38lQ7TSE6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Stk38lQ7TSE6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Stk38lQ7TSE6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Stk38lQ7TSE6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Stk38lQ7TSE6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Stk38lQ7TSE6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Stk38lQ7TSE6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Stk38lQ7TSE6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Stk38lQ7TSE6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Stk38lQ7TSE6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Stk38lQ7TSE6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Stk38lQ7TSE6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Stk38lQ7TSE6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Stk38lQ7TSE6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Stk38lQ7TSE6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Stk38lQ7TSE6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Stk38lQ7TSE6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Stk38lQ7TSE6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Stk38lQ7TSE6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Stk38lQ7TSE6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Stk38lQ7TSE6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Stk38lQ7TSE6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Stk38lQ7TSE6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stk38lQ7TSE6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Stk38lQ7TSE6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stk38lQ7TSE6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stk38lQ7TSE6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stk38lQ7TSE6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stk38lQ7TSE6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stk38lQ7TSE6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Stk38lQ7TSE6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stk38lQ7TSE6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Stk38lQ7TSE6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stk38lQ7TSE6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stk38lQ7TSE6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stk38lQ7TSE6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stk38lQ7TSE6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Stk38lQ7TSE6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stk38lQ7TSE6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stk38lQ7TSE6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Stk38lQ7TSE6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stk38lQ7TSE6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Stk38lQ7TSE6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Stk38lQ7TSE6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stk38lQ7TSE6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stk38lQ7TSE6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stk38lQ7TSE6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stk38lQ7TSE6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stk38lQ7TSE6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stk38lQ7TSE6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stk38lQ7TSE6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Stk38lQ7TSE6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stk38lQ7TSE6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stk38lQ7TSE6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stk38lQ7TSE6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stk38lQ7TSE6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stk38lQ7TSE6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Stk38lQ7TSE6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Stk38lQ7TSE6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stk38lQ7TSE6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stk38lQ7TSE6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stk38lQ7TSE6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stk38lQ7TSE6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stk38lQ7TSE6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stk38lQ7TSE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stk38lQ7TSE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stk38lQ7TSE6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stk38lQ7TSE6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stk38lQ7TSE6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stk38lQ7TSE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stk38lQ7TSE6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stk38lQ7TSE6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stk38lQ7TSE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Stk38lQ7TSE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stk38lQ7TSE6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stk38lQ7TSE6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stk38lQ7TSE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stk38lQ7TSE6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stk38lQ7TSE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stk38lQ7TSE6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stk38lQ7TSE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stk38lQ7TSE6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stk38lQ7TSE6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stk38lQ7TSE6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stk38lQ7TSE6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stk38lQ7TSE6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stk38lQ7TSE6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stk38lQ7TSE6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stk38lQ7TSE6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stk38lQ7TSE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stk38lQ7TSE6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stk38lQ7TSE6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stk38lQ7TSE6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stk38lQ7TSE6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stk38lQ7TSE6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stk38lQ7TSE6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stk38lQ7TSE6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms