Protein–RNA interactions for Protein: Q6SKR2

N6amt1, HemK methyltransferase family member 2, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N6amt1Q6SKR2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
N6amt1Q6SKR2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
N6amt1Q6SKR2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
N6amt1Q6SKR2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N6amt1Q6SKR2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
N6amt1Q6SKR2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
N6amt1Q6SKR2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
N6amt1Q6SKR2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N6amt1Q6SKR2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N6amt1Q6SKR2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
N6amt1Q6SKR2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
N6amt1Q6SKR2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
N6amt1Q6SKR2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
N6amt1Q6SKR2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
N6amt1Q6SKR2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
N6amt1Q6SKR2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N6amt1Q6SKR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N6amt1Q6SKR2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N6amt1Q6SKR2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
N6amt1Q6SKR2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
N6amt1Q6SKR2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N6amt1Q6SKR2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
N6amt1Q6SKR2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
N6amt1Q6SKR2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
N6amt1Q6SKR2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
N6amt1Q6SKR2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
N6amt1Q6SKR2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N6amt1Q6SKR2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N6amt1Q6SKR2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N6amt1Q6SKR2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
N6amt1Q6SKR2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N6amt1Q6SKR2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N6amt1Q6SKR2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N6amt1Q6SKR2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N6amt1Q6SKR2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
N6amt1Q6SKR2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N6amt1Q6SKR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N6amt1Q6SKR2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N6amt1Q6SKR2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N6amt1Q6SKR2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N6amt1Q6SKR2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N6amt1Q6SKR2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
N6amt1Q6SKR2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N6amt1Q6SKR2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
N6amt1Q6SKR2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N6amt1Q6SKR2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N6amt1Q6SKR2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N6amt1Q6SKR2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
N6amt1Q6SKR2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
N6amt1Q6SKR2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N6amt1Q6SKR2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N6amt1Q6SKR2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
N6amt1Q6SKR2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
N6amt1Q6SKR2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
N6amt1Q6SKR2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
N6amt1Q6SKR2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
N6amt1Q6SKR2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N6amt1Q6SKR2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N6amt1Q6SKR2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N6amt1Q6SKR2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N6amt1Q6SKR2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N6amt1Q6SKR2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
N6amt1Q6SKR2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N6amt1Q6SKR2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N6amt1Q6SKR2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N6amt1Q6SKR2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N6amt1Q6SKR2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N6amt1Q6SKR2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N6amt1Q6SKR2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N6amt1Q6SKR2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N6amt1Q6SKR2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
N6amt1Q6SKR2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N6amt1Q6SKR2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N6amt1Q6SKR2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N6amt1Q6SKR2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N6amt1Q6SKR2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N6amt1Q6SKR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N6amt1Q6SKR2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
N6amt1Q6SKR2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
N6amt1Q6SKR2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
N6amt1Q6SKR2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N6amt1Q6SKR2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N6amt1Q6SKR2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N6amt1Q6SKR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
N6amt1Q6SKR2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N6amt1Q6SKR2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N6amt1Q6SKR2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N6amt1Q6SKR2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N6amt1Q6SKR2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
N6amt1Q6SKR2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N6amt1Q6SKR2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N6amt1Q6SKR2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
N6amt1Q6SKR2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
N6amt1Q6SKR2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
N6amt1Q6SKR2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
N6amt1Q6SKR2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
N6amt1Q6SKR2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
N6amt1Q6SKR2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
N6amt1Q6SKR2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
N6amt1Q6SKR2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms