Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR0

Klhdc10, Kelch domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc10Q6PAR0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Klhdc10Q6PAR0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Klhdc10Q6PAR0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Klhdc10Q6PAR0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Klhdc10Q6PAR0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Klhdc10Q6PAR0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Klhdc10Q6PAR0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Klhdc10Q6PAR0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Klhdc10Q6PAR0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Klhdc10Q6PAR0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Klhdc10Q6PAR0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Klhdc10Q6PAR0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Klhdc10Q6PAR0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Klhdc10Q6PAR0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Klhdc10Q6PAR0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Klhdc10Q6PAR0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Klhdc10Q6PAR0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Klhdc10Q6PAR0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Klhdc10Q6PAR0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Klhdc10Q6PAR0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Klhdc10Q6PAR0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Klhdc10Q6PAR0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Klhdc10Q6PAR0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Klhdc10Q6PAR0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Klhdc10Q6PAR0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Klhdc10Q6PAR0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Klhdc10Q6PAR0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Klhdc10Q6PAR0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Klhdc10Q6PAR0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Klhdc10Q6PAR0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Klhdc10Q6PAR0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Klhdc10Q6PAR0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Klhdc10Q6PAR0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Klhdc10Q6PAR0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Klhdc10Q6PAR0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klhdc10Q6PAR0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Klhdc10Q6PAR0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klhdc10Q6PAR0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klhdc10Q6PAR0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klhdc10Q6PAR0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klhdc10Q6PAR0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klhdc10Q6PAR0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klhdc10Q6PAR0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Klhdc10Q6PAR0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klhdc10Q6PAR0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Klhdc10Q6PAR0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Klhdc10Q6PAR0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klhdc10Q6PAR0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Klhdc10Q6PAR0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Klhdc10Q6PAR0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klhdc10Q6PAR0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Klhdc10Q6PAR0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Klhdc10Q6PAR0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Klhdc10Q6PAR0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Klhdc10Q6PAR0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klhdc10Q6PAR0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klhdc10Q6PAR0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klhdc10Q6PAR0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Klhdc10Q6PAR0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klhdc10Q6PAR0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klhdc10Q6PAR0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klhdc10Q6PAR0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klhdc10Q6PAR0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Klhdc10Q6PAR0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klhdc10Q6PAR0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klhdc10Q6PAR0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhdc10Q6PAR0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhdc10Q6PAR0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klhdc10Q6PAR0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klhdc10Q6PAR0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klhdc10Q6PAR0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klhdc10Q6PAR0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Klhdc10Q6PAR0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klhdc10Q6PAR0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klhdc10Q6PAR0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klhdc10Q6PAR0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Klhdc10Q6PAR0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Klhdc10Q6PAR0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Klhdc10Q6PAR0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Klhdc10Q6PAR0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Klhdc10Q6PAR0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Klhdc10Q6PAR0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Klhdc10Q6PAR0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Klhdc10Q6PAR0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Klhdc10Q6PAR0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Klhdc10Q6PAR0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klhdc10Q6PAR0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Klhdc10Q6PAR0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klhdc10Q6PAR0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klhdc10Q6PAR0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhdc10Q6PAR0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhdc10Q6PAR0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klhdc10Q6PAR0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Klhdc10Q6PAR0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Klhdc10Q6PAR0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Klhdc10Q6PAR0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klhdc10Q6PAR0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Klhdc10Q6PAR0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klhdc10Q6PAR0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klhdc10Q6PAR0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms