Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Capn11Q6J756 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Capn11Q6J756 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Capn11Q6J756 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Capn11Q6J756 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Capn11Q6J756 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Capn11Q6J756 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Capn11Q6J756 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Capn11Q6J756 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Capn11Q6J756 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Capn11Q6J756 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Capn11Q6J756 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Capn11Q6J756 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Capn11Q6J756 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Capn11Q6J756 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Capn11Q6J756 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Capn11Q6J756 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Capn11Q6J756 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Capn11Q6J756 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Capn11Q6J756 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Capn11Q6J756 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Capn11Q6J756 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Capn11Q6J756 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Capn11Q6J756 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Capn11Q6J756 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Capn11Q6J756 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Capn11Q6J756 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Capn11Q6J756 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Capn11Q6J756 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Capn11Q6J756 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Capn11Q6J756 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Capn11Q6J756 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Capn11Q6J756 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Capn11Q6J756 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Capn11Q6J756 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Capn11Q6J756 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Capn11Q6J756 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Capn11Q6J756 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Capn11Q6J756 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Capn11Q6J756 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Capn11Q6J756 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Capn11Q6J756 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Capn11Q6J756 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn11Q6J756 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capn11Q6J756 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capn11Q6J756 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capn11Q6J756 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Capn11Q6J756 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn11Q6J756 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn11Q6J756 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn11Q6J756 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capn11Q6J756 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capn11Q6J756 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capn11Q6J756 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capn11Q6J756 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Capn11Q6J756 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn11Q6J756 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Capn11Q6J756 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Capn11Q6J756 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Capn11Q6J756 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn11Q6J756 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn11Q6J756 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Capn11Q6J756 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Capn11Q6J756 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn11Q6J756 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn11Q6J756 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn11Q6J756 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn11Q6J756 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn11Q6J756 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn11Q6J756 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Capn11Q6J756 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Capn11Q6J756 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Capn11Q6J756 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Capn11Q6J756 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Capn11Q6J756 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Capn11Q6J756 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Capn11Q6J756 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn11Q6J756 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn11Q6J756 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn11Q6J756 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn11Q6J756 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn11Q6J756 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Capn11Q6J756 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn11Q6J756 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn11Q6J756 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capn11Q6J756 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Capn11Q6J756 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capn11Q6J756 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Capn11Q6J756 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Capn11Q6J756 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Capn11Q6J756 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn11Q6J756 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn11Q6J756 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn11Q6J756 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Capn11Q6J756 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Capn11Q6J756 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn11Q6J756 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn11Q6J756 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Capn11Q6J756 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capn11Q6J756 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms