Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQS1

Slc25a23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a23Q6GQS1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Slc25a23Q6GQS1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Slc25a23Q6GQS1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Slc25a23Q6GQS1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Slc25a23Q6GQS1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Slc25a23Q6GQS1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Slc25a23Q6GQS1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slc25a23Q6GQS1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slc25a23Q6GQS1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc25a23Q6GQS1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc25a23Q6GQS1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc25a23Q6GQS1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc25a23Q6GQS1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc25a23Q6GQS1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc25a23Q6GQS1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc25a23Q6GQS1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc25a23Q6GQS1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc25a23Q6GQS1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc25a23Q6GQS1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc25a23Q6GQS1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc25a23Q6GQS1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc25a23Q6GQS1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc25a23Q6GQS1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc25a23Q6GQS1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc25a23Q6GQS1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc25a23Q6GQS1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc25a23Q6GQS1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc25a23Q6GQS1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc25a23Q6GQS1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Slc25a23Q6GQS1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slc25a23Q6GQS1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slc25a23Q6GQS1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slc25a23Q6GQS1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Slc25a23Q6GQS1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc25a23Q6GQS1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc25a23Q6GQS1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc25a23Q6GQS1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc25a23Q6GQS1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc25a23Q6GQS1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc25a23Q6GQS1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc25a23Q6GQS1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc25a23Q6GQS1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slc25a23Q6GQS1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc25a23Q6GQS1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc25a23Q6GQS1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc25a23Q6GQS1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc25a23Q6GQS1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc25a23Q6GQS1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc25a23Q6GQS1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc25a23Q6GQS1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc25a23Q6GQS1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc25a23Q6GQS1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc25a23Q6GQS1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc25a23Q6GQS1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc25a23Q6GQS1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc25a23Q6GQS1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc25a23Q6GQS1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc25a23Q6GQS1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc25a23Q6GQS1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc25a23Q6GQS1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc25a23Q6GQS1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc25a23Q6GQS1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc25a23Q6GQS1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc25a23Q6GQS1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc25a23Q6GQS1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc25a23Q6GQS1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc25a23Q6GQS1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc25a23Q6GQS1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc25a23Q6GQS1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc25a23Q6GQS1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc25a23Q6GQS1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc25a23Q6GQS1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc25a23Q6GQS1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc25a23Q6GQS1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc25a23Q6GQS1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc25a23Q6GQS1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc25a23Q6GQS1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc25a23Q6GQS1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc25a23Q6GQS1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc25a23Q6GQS1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc25a23Q6GQS1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc25a23Q6GQS1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc25a23Q6GQS1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc25a23Q6GQS1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc25a23Q6GQS1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc25a23Q6GQS1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc25a23Q6GQS1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc25a23Q6GQS1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc25a23Q6GQS1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc25a23Q6GQS1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc25a23Q6GQS1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc25a23Q6GQS1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc25a23Q6GQS1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc25a23Q6GQS1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc25a23Q6GQS1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc25a23Q6GQS1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc25a23Q6GQS1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc25a23Q6GQS1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc25a23Q6GQS1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc25a23Q6GQS1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms